De Area Under the Disease Progress Curve (AUDPC) is een kwantitatieve maat voor de intensiteit van de ziekte met de tijd. Het wordt gebruikt in plantenpathologie om niveaus van resistentie tegen ziekten bij plantenrassen aan te geven en te vergelijken. De trapeziummethode. Is de meest gebruikelijke manier om AUDPC te berekenen. Het wordt uitgevoerd met behulp van een formule bedacht door Campbell en Madden in 1990 of door het plotten van een grafiek van het percentage infectie tegen de tijd en het optellen van de trapezoïden tussen tijdsintervallen.

Meet Progressie van de ziekte

Onderzoeksregels en richtlijnen die van toepassing zijn op het meten van de specifieke ziekte en het gewas dat u onderzoekt. De vereiste grootte van het plantenmonster varieert per gewas en ziekte. Bestudering van Phytophthora in knollen vereist bijvoorbeeld een minimum van 40 planten.

Plant het juiste aantal planten dat nodig is voor de studie.

Let goed op tekenen van de ziekte. Onderzoek wanneer er tekenen worden verwacht die zich voordoen, zodat u voorbereid bent. Tekenen van aardappelziekte komen bijvoorbeeld ongeveer 30 tot 40 dagen na het planten en 10 dagen na de laatste toediening van fungicide voor.

Beoordeel visueel het percentage van het besmette blad in uw monster zodra u de ziekte opmerkt.

Registreer het percentage geïnfecteerd bladoppervlak op regelmatige tijdsintervallen. Onderzoekers lezen om de zeven dagen voor de late bacterievuur als de ziekte sneller verloopt dan verwacht. Er worden om de 14 dagen metingen gedaan als de progressie van de ziekte langzamer is.

Stop met het opnemen van infectiemetingen wanneer het percentage van de infectie niet meer stijgt en de ziektevoortgangsniveaus.

Bereken AUDPC uit een vergelijking

Voeg de eerste twee infectiepercentages toe die u hebt opgenomen.

Deel het optelresultaat door twee om de gemiddelde of gemiddelde waarde van de twee waarden te vinden.

Vermenigvuldig de gemiddelde of middenwaarde met het tijdsinterval, dat is het aantal dagen van de eerste tot de tweede meting. Als u bijvoorbeeld de eerste meting op dag 20 en de tweede meting op dag 27 hebt gedaan, is het aantal dagen of tijdsinterval zeven dagen.

Noteer het resultaat in eenheden van percentage dagen. De waarde is een gebied van een trapezoïde.

Herhaal stap één tot en met vier voor de tweede en derde infectie die u hebt gemeten. Hun resultaat is het gebied van een tweede trapezium. Herhaal stap één tot en met vier totdat u trapeziumgebieden berekende voor alle waarden.

Voeg alle trapeziums toe om de AUDPC te vinden. Lagere AUDPC's vertegenwoordigen een tragere ziekteprogressie en een grotere weerstand tegen de ziekte. Hogere AUDPC's vertegenwoordigen een snellere progressie van de ziekte en een hogere vatbaarheid voor de ziekte.

Tip

AUDPC wordt ook gevonden door het percentage infectie tegen de tijd in een grafiek uit te zetten. Het gebied van elke trapezium tussen de meetwaarden wordt berekend met behulp van eenvoudige geometrie.

AUDPC maakt het mogelijk dat tijdsintervallen tussen metingen variëren, maar de metingen moeten beginnen kort nadat de ziekte begint. Een lange wachttijd resulteert in gevoelige materialen die geen deel uitmaken van de ziektevoortgangscurve.

Waarschuwingstest

Vanwege de schatting die wordt gebruikt om het percentage infecties vast te stellen, wordt AUDPC als een pseudo-kwantitatieve variabele beschouwd. De AUDPC is slechts een schatting van het gebied onder de feitelijke infectiecurve.

De AUDPC is over het algemeen niet vergelijkbaar voor verschillende experimenten vanwege verschillende factoren, zoals de aanwezigheid van ongunstige of gunstige ziektetoestanden.