Ontbossing is het kappen van bossen om hout te verkrijgen en ruimte te bieden voor landbouwgebieden of stadsontwikkeling. Als gevolg van massale mondiale verstedelijking en landbouwontwikkeling is ontbossing een belangrijke factor die bijdraagt aan de klimaatverandering. Ontbossing verandert niet alleen nabijgelegen ecosystemen - gemeenschappen van op elkaar inwerkende organismen en hun omgeving - maar ook de atmosfeer op mondiaal niveau, met verwoestende resultaten.
Biodiversiteit

Biodiversiteit is het aantal soorten in een bepaald ecosysteem . Omdat verschillende soorten verschillende voedingsmiddelen eten en in verschillende soorten habitats leven, kan een gevarieerde set vegetatie een grotere verscheidenheid aan dieren in een gebied laten leven. Wanneer bossen worden gekapt om ruimte te maken voor grote plantages die één soort gewas verbouwen, zoals suikerriet of soja, neigt de diversiteit van dieren in het wild naarmate de soorten worden verplaatst. Als gewassen echter op kleinere schaal worden geïntroduceerd en de inheemse soorten niet verdringen, kunnen ze de diversiteit vergroten, omdat ze kunnen fungeren als een habitat voor vogels en herbivoren.
Waterchemie

Ontbossing is ook van invloed op nabijgelegen rivieren, beken en andere waterbronnen als voedingsstoffen uit de bodem worden verwijderd door uitloging, wat gebeurt wanneer water (bijv. uit regen) oplosbare voedingsstoffen uit de grond verwijdert en ze elders vervoert. Waterbronnen in ontboste gebieden bleken hogere nitraatgehaltes, lagere opgeloste zuurstofgehaltes en iets hogere temperaturen (gemiddeld van 20 tot 23 graden Celsius) te hebben dan in bosrijke gebieden. Watertemperaturen stijgen omdat de bomen die dekking bieden tegen zonlicht worden gekapt. Al deze factoren verstoren een rivierecosysteem omdat de soorten die in de stroom leven zich hebben aangepast aan de omstandigheden vóór de ontbossing en mogelijk negatief worden beïnvloed door de plotselinge veranderingen.
De atmosfeer

Ontbossing beïnvloedt niet alleen een bos en zijn directe omgeving, maar ook de atmosfeer, die op zijn beurt zich verspreidt over de biosfeer - alle ecosystemen van de planeet en alles daarin. Volgens een congresstudie uit 2010 komt 17 procent van alle broeikasgasemissies voort uit ontbossing, door zowel brandende bomen als het daaruit voortvloeiende verlies van fotosynthese, waardoor koolstofdioxide (een broeikasgas) uit de atmosfeer wordt verwijderd. Terwijl bomen worden gekapt en verbrand, komt de koolstof die ze bevatten vrij in de atmosfeer. Hoewel de verhoogde hoeveelheid koolstofdioxide de bosgroei kan stimuleren, zijn meer gegevens nodig om de langetermijneffecten te meten.
Bodemeffect

De bodem die voedingsstoffen voor vegetatie in ecosystemen levert, wordt ook beïnvloed door ontbossing. Bodem in ontboste gebieden wordt blootgesteld aan meer zonlicht, wat de bodemtemperatuur verhoogt en de koolstof in de bodem oxideert tot koolstofdioxide. Een deel van de koolstofdioxide die in de atmosfeer vrijkomt, is afkomstig van dode vegetatie die in de grond ontbindt. In sterk ontboste gebieden komen bodemerosie en afvoer van voedingsstoffen veel voor na een regenval. Bodemerosie is meestal groter in drogere, meer bergachtige gebieden, waar minder vegetatie is om de beweging van de bodem te voorkomen en de voedingsstoffen te absorberen.
Verspreidingsziekte

Een mogelijk indirect gevolg van ontbossing is de verspreiding van ziekten, inclusief die afkomstig van vogels, zoals vogelgriep. Klimaatverandering heeft migratiepatronen al beïnvloed, en besmette vogels kunnen verhuizen naar ontboste gebieden die geschikter zijn voor hen en hun ziekten verspreiden onder de plaatselijke vogelpopulaties. Ziekten die worden overgedragen door insecten, zoals malaria en de ziekte van Lyme, komen vaker voor in open ruimtes met meer blootstelling aan zonlicht. Deze ziekten infecteren niet alleen vogels en gewervelde dieren die in deze ecosystemen worden aangetroffen, maar ook mensen die worden blootgesteld aan deze insecten, hetzij in het wild of in nabijgelegen stedelijke gebieden.