Tropische regenwouden zijn een van de biologisch meest diverse habitats op aarde, maar de beschrijving van flora en fauna en het begrip van hun evolutionaire geschiedenis zijn verre van compleet. Omdat ze een bron zijn van duurzame hulpbronnen, waaronder potentiële geneesmiddelen, keuken en hout, er is een toenemende behoefte aan het beoordelen van mondiale biodiversiteitsveranderingen.

Het GLDAFRICA-project koos ervoor om een ​​onderfamilie van de peulvruchten te bestuderen, de Detarioideae, om de geografische patronen van soortenrijkdom te onderzoeken. "Door gebruik te maken van sequencing van de volgende generatie, we willen hotspots van evolutionaire diversiteit en recente soortvormingsgebeurtenissen in West-Centraal-Afrika identificeren, " schetst Dr. Felix Forest, project coördinator.

De takken construeren om bij de boom te komen

Het extraheren van geschikte DNA-sequenties uit een paar plastidemarkers, het team gebruikte standaardmethoden om de evolutionaire of fylogenetische relaties tussen de leden van de groep te reconstrueren. "Vervolgens gebruikten we de resulterende boom om de biogeografische patronen en bioomverschuivingen binnen de onderfamilie te onderzoeken, " vervolgt Dr. Forest. Biomen hebben een groter bereik dan habitat, gemeenschappen zijn die zich hebben aangepast als reactie op een gedeeld fysiek klimaat.

De volgende stap was het verzamelen van veel meer DNA-sequentiegegevens, wat zou moeten resulteren in een meer gedetailleerde fylogenetische boom. De man met het GLDAFRICA-project, Dokter Manuel de la Estrella, ontwikkelde een gerichte verrijkingsbenadering die een beter opgeloste boom met meer gedetailleerde evolutionaire relaties mogelijk maakt. "Het resultaat was dat we een paar honderd markers uit de kern konden sequencen. Analyses zijn aan de gang en de nieuwe boom wordt binnen de komende maanden verwacht, "Dokter Forest informeerde ons.

Een belangrijk resultaat tot nu toe is dat het werk is gebruikt als bewijs voor een nieuwe classificatie in de onderfamilie van peulvruchten. "De stam Detarioideae is onlangs opgewaardeerd tot het onderfamilieniveau en heet nu onderfamilie Detarioideae, "Verklaart Dr. Forest. "Verdere analyse zal hoogstwaarschijnlijk de manier veranderen waarop we de evolutie van deze belangrijke groep West-Afrikaanse planten bekijken."

Op zoek naar toekomstige beoordeling van instandhouding en bedreigingen voor soorten

Instandhoudingsbeoordelingen van de International Union for the Conservation of Nature (IUCN) zijn een ander resultaat, en "deze zullen worden gebruikt om een ​​[evolutionair verschillende en wereldwijd bedreigde] EDGE-lijst te produceren van de meest bedreigde en evolutionair verschillende soorten in de Detarioideae-groep, ", stelt dr. Bos.

Het gebruik van gegevens kan worden uitgebreid tot voorspellingen over waar de soort in verschillende klimaatscenario's in de boom terecht zal komen. "Als al het schoppenwerk gedaan is, we zullen soortmodellering en de voorspellingen van het Intergouvernementeel Panel over klimaatverandering gebruiken om het lot van soorten in de toekomst te onderzoeken."

De hoeveelheid geproduceerde gegevens is veel groter dan aanvankelijk werd verwacht voor het project en het team werkt nog steeds aan de analyse voor de definitieve resultaten en publicatie. Er zijn al twee artikelen gepubliceerd over de evolutie van Detarioideae, een in Nieuwe fytoloog en de andere in de Internationaal tijdschrift voor plantenwetenschappen .

"GLDAFRICA concentreerde zich op de onderfamilie Detarioideae uit West-Afrika. De volgende stap is om deze studie uit te breiden naar de neotropische soorten. We hebben al wat pilootfinanciering verkregen om de haalbaarheid hiervan te onderzoeken en het ziet er veelbelovend uit, "Dokter Forest besluit.

De fylogenetische boom die is gegroeid uit GLDAFRICA-onderzoek zal de meest complete zijn voor zo'n grote groep peulvruchten. Gezien het eco-economische belang van deze groep in West-Afrikaanse regenwouden, het zal als basis dienen voor veel evolutionaire studies die de evolutie en ecologie van deze verbazingwekkende ecosystemen zullen onderzoeken.