Er is nooit enig overtuigend bewijs geweest dat de juistheid van de phlogistontheorie aantoonde, en er werden zelfs enkele experimenten uitgevoerd aan het eind van de 18e eeuw die deze theorie begonnen te weerleggen. Dit komt omdat de theorie gebaseerd was op een misverstand over hoe verbranding en andere chemische reacties feitelijk plaatsvinden.