Zijn model, vaak het pruimpuddingmodel genoemd , Afgebeelde het atoom als een bol van positieve lading met negatief geladen elektronen ingebed, net als pruimen in een pudding.

Hoewel het niet helemaal nauwkeurig is, was het model van Thomson een belangrijke stap voorwaarts van eerdere modellen, omdat het het idee van subatomaire deeltjes en hun opstelling in het atoom introduceerde.