Fermentatie is een metabolisch proces dat door de werking van enzymen chemische veranderingen in organische substraten teweegbrengt. In de biochemie wordt het eng gedefinieerd als het proces waarbij glucose anaëroob wordt afgebroken.

Omdat dit plaatsvindt in afwezigheid van zuurstof, wordt dit anaërobe ademhaling genoemd in tegenstelling tot aerobe ademhaling (met zuurstof).