In een NH3-molecuul heeft het stikstofatoom een ​​grotere elektronegativiteit dan de waterstofatomen. Dit betekent dat het stikstofatoom sterker elektronen aantrekt dan de waterstofatomen, waardoor een gedeeltelijke negatieve lading op het stikstofatoom ontstaat en een gedeeltelijke positieve lading op elk waterstofatoom. Deze gedeeltelijke ladingen creëren polaire bindingen tussen het stikstofatoom en elk waterstofatoom.

De polariteit van het NH3-molecuul wordt ook beïnvloed door de moleculaire geometrie ervan. Het stikstofatoom in NH3 is omgeven door drie waterstofatomen in een trigonale piramidale opstelling. Deze geometrie creëert een dipoolmoment, dat een maat is voor de polariteit van een molecuul. Het dipoolmoment van NH3 is gericht van het stikstofatoom naar het midden van de driehoek gevormd door de waterstofatomen.

De polariteit van het NH3-molecuul heeft verschillende belangrijke gevolgen. Het zorgt er bijvoorbeeld voor dat NH3 oplost in water en andere polaire oplosmiddelen. Het maakt NH3 ook tot een goed nucleofiel, wat betekent dat het elektronen aan andere moleculen kan doneren.