Jeremy Edwards, directeur van het Computational Genomics and Technology (CGaT) Laboratory aan de Universiteit van New Mexico, en zijn collega's bij Centrillion Technologies in Palo Alto, Californië en de Universiteit van West Virginia, hebben een chip ontwikkeld die een eenvoudigere en snellere methode biedt voor genoomsequencing voor virussen zoals COVID-19.

Hun onderzoek, getiteld "Highly Accurate Chip-Based Resequencing of SARS-CoV-2 Clinical Samples" werd onlangs gepubliceerd in de American Chemical Society's Langmuir . Als onderdeel van het onderzoek, wetenschappers creëerden een betegelde genoomarray die ze ontwikkelden voor snelle en goedkope volledige resequencing van het virale genoom en pasten hun SARS-CoV-2-specifieke genome tiling-array toe om snel en nauwkeurig het virale genoom te resequeneren van acht klinische monsters verkregen van patiënten in Wyoming die positief testten voor SARS-CoV-2. uiteindelijk, ze waren in staat om 95 procent van het genoom van elk monster te sequensen met een nauwkeurigheid van meer dan 99,9 procent.

"Deze nieuwe technologie zorgt voor een snellere en nauwkeurigere opsporing van COVID en andere respiratoire virussen, inclusief het verschijnen van nieuwe varianten, " zei Eduard, die een professor is in de UNM-afdeling Chemie en Chemische Biologie. "Met deze eenvoudige en snelle testprocedure, wetenschappers zullen de voortgang nauwkeuriger kunnen volgen en het begin van de volgende pandemie beter kunnen voorkomen."

Met meer dan 142 miljoen mensen wereldwijd die het virus hebben opgelopen, waakzaam testen en contacttracering zijn de meest effectieve manieren om de verspreiding van COVID-19 te vertragen. Traditionele klinische testmethoden produceren vaak valse positieven of negatieven, en traditionele methoden van sequencing zijn tijdrovend en duur. Deze nieuwe technologie zal vrijwel al deze barrières wegnemen.

"Sinds de indiening van het papier, de technologie is verder geëvolueerd met verbeterde nauwkeurigheid en gevoeligheid, " zei Edwards. "De chiptechnologie is de best beschikbare technologie voor grootschalige virale genoomsurveillance en het monitoren van virale varianten. Deze technologie kan niet alleen helpen deze pandemie onder controle te houden en ook toekomstige pandemieën te voorkomen."