In een paper gepubliceerd in de Tijdschrift voor biologische chemie , Dr. Özdemir heeft twee eiwitfamilies bestudeerd, genaamd Rho GTPases en IQGAPs, waarvan bekend is dat ze een belangrijke rol spelen bij de uitzaaiing van kanker. Deze twee "verdachte" eiwitfamilies zijn door de jaren heen door veel onderzoekers bestudeerd, maar de interactie tussen hen was niet eerder volledig begrepen.

Het is belangrijk om te begrijpen hoe metastase, de verspreiding van kanker van de primaire plaats naar andere organen, vindt plaats, omdat het voorkomen van metastasen betekent dat u kanker onder controle moet houden. Dit is de reden waarom Dr. Özdemir ervoor koos om deze eiwitten te bestuderen, waarvan bekend is dat ze metastase activeren.

Vereist een grote hoeveelheid probabilistische berekening, de studie werd alleen mogelijk gemaakt door computationele simulatietechnieken met behulp van zeer krachtige computers. De onderzoekers bouwden een simulatieomgeving waarin veel elementen zoals de waterdichtheid in de cel, de ionen en de driedimensionale structuur van de eiwitten werden heel precies gesimuleerd. Dit maakte het mogelijk om te observeren hoe de twee eiwitten precies op elkaar inwerkten, de punten waarop ze belanden, en welke morfologische veranderingen de binding veroorzaakte in de eiwitten.

De simulatie duurde zes maanden. De studie observeerde de bindingspunten en de volgorde van de twee eiwitten, hoe het grote eiwit zijn match vond, en hoe de twee complexe structuren met elkaar verbonden zijn. En er werd vastgesteld dat de complexe structuren die zich vormden de mechanismen activeerden die metastase in cellen veroorzaakten.

De studie van Dr. Sıla Özdemir werd getest en gerepliceerd op kankercellen in een laboratoriumomgeving door een andere onderzoeksgroep van de National Institutes of Health in de Verenigde Staten (NIH), en de resultaten toonden een exacte overeenkomst:het experiment verifieerde de gegevens die door de computersimulaties waren geproduceerd. Het belangrijkste resultaat van deze ontdekking zal zijn bijdrage aan het ontwerp van een medicijn dat zich richt op het mechanisme in kwestie.

Na de publicatie in de Tijdschrift voor biologische chemie , een van de meest prestigieuze tijdschriften op dit gebied, Het onderzoek van Dr. Özdemir werd vervolgens gepubliceerd als onderdeel van een speciale collectie van het tijdschrift van de meest invloedrijke kranten van 2018.