Een open leesframe (ORF) is een sequentie van DNA of RNA dat kan worden vertaald in een eiwit. Het wordt gekenmerkt door:

1. Start codon: Een ORF begint met een startcodon, meestal aug (methionine).

2. Stop Codon: Een ORF eindigt met een stopcodon, meestal UAA, UAG of UGA.

3. Continu coderende reeks: De volgorde tussen de start- en stopcodons is een continu stuk codons die in een eiwit kunnen worden vertaald.

4. Leesframe: ORF's worden gelezen in een specifiek leeskader, wat betekent dat de codons zijn gegroepeerd in sets van drie nucleotiden.

Betekenis van ORF's:

* eiwitsynthese: ORF's bieden de genetische informatie die nodig is voor eiwitsynthese.

* genidentificatie: Het identificeren van ORF's is een cruciale stap in genvoorspelling en annotatie.

* Functionele analyse: Het analyseren van ORF's kan helpen bij het bepalen van de functie van genen.

* evolutionaire studies: ORF's spelen een rol bij het begrijpen van evolutionaire relaties tussen organismen.

ORF's vinden:

ORF's worden doorgaans geïdentificeerd met behulp van bio -informatieme hulpmiddelen die zoeken naar de volgende functies:

* Start en stop codons

* coderingssequentielengte

* sequentiehomologie met bekende genen

Voorbeeld:

`` `

... atggtgcaaggttacgtgtag ...

`` `

In deze reeks is de ORF:

* Start codon: Augustus

* Stop Codon: UAG

* Coderingsequentie: Atggtgcaaggttacgtgt

Opmerking:

* Niet alle ORF's worden vertaald in eiwitten. Sommige ORF's kunnen niet-coderend zijn of kunnen coderen voor niet-eiwitcoderende RNA's.

* De lengte en volgorde van een ORF kan sterk variëren tussen genen.

* Het concept van ORF's is essentieel voor het begrijpen van genexpressie en eiwitfunctie.