Hoewel bacteriën en schimmels beide microscopische organismen zijn en een belangrijke rol spelen in de omgeving, zijn ze eigenlijk heel anders. Hier zijn enkele van hun overeenkomsten:

* beide zijn alomtegenwoordig: Ze worden bijna overal op aarde gevonden, van grond en water tot ons lichaam.

* Beide zijn ontleders: Ze breken dode organische stof af en recyclen voedingsstoffen terug in het ecosysteem.

* beide kunnen gunstig zijn: Ze zijn essentieel voor processen zoals fermentatie en voedingsstoffen en sommige worden gebruikt bij het produceren van voedsel en medicijnen.

* beide kunnen schadelijk zijn: Sommige bacteriën en schimmels kunnen ziekten veroorzaken bij mensen, dieren en planten.

Deze overeenkomsten worden echter overschaduwd door hun vele verschillen. Hier is een uitsplitsing van hun belangrijkste verschillen:

Structuur:

* bacteriën: Eencellige organismen met een eenvoudige structuur, zonder een echte kern- en membraangebonden organellen.

* Fungi: Eukaryotische organismen, wat betekent dat ze een echte kern en complexe organellen hebben. Ze kunnen eencellig (gisten) of meercellige (vormen en champignons) zijn.

Celwand:

* bacteriën: Heb celwanden samengesteld uit peptidoglycan.

* Fungi: Heb celwanden samengesteld uit chitine, een taai polysacharide.

Voedingswijze:

* bacteriën: Kan heterotrofe zijn (verkrijg voedingsstoffen van andere organismen) of autotrofe (produceren hun eigen voedsel door fotosynthese of chemosynthese).

* Fungi: Heterotrofe, het verkrijgen van voedingsstoffen door voedingsstoffen uit hun omgeving te absorberen door hyfen, lange draadachtige structuren.

Reproductie:

* bacteriën: Reproduceer aseksueel door binaire splijting.

* Fungi: Reproduceer aseksueel door sporen of ontluikende en seksueel door de fusie van hyfen.

Over het algemeen, hoewel bacteriën en schimmels enkele overeenkomsten delen, zijn hun structurele, genetische en functionele verschillen significant.