1. Transcriptiefactoren:

* Definitie: Deze eiwitten binden aan specifieke DNA -sequenties (promoters, versterkers, geluiddempers) in de buurt van het gen dat ze reguleren.

* functie: Ze fungeren als moleculaire schakelaars, het activeren of onderdrukken van transcriptie.

* Voorbeelden:

* Algemene transcriptiefactoren: Vereist voor de start van transcriptie van de meeste genen (bijv. Tata-bindend eiwit).

* Specifieke transcriptiefactoren: Binden aan specifieke regulerende sequenties, vaak beïnvloed door externe signalen (bijv. P53, NF-KB).

2. Co-factoren en co-regulatoren:

* Definitie: Eiwitten die associëren met transcriptiefactoren om hun activiteit te moduleren.

* functie: Ze kunnen als bruggen werken om transcriptiefactoren te verbinden met andere componenten van de transcriptiemachines, de bindingsaffiniteit van transcriptiefactoren aan DNA te wijzigen of hun activiteit te wijzigen.

* Voorbeelden:

* Histone acetyltransferasen (hoeden): Acetylaathistonen, waardoor DNA toegankelijker wordt voor transcriptiefactoren.

* Histone deacetylases (HDACS): Deacetylaat histonen, waardoor DNA minder toegankelijk is en transcriptie onderdrukt.

* Mediator Complex: Een groot complex van eiwitten dat werkt als een brug tussen transcriptiefactoren en RNA -polymerase II.

3. Chromatine remodelleringscomplexen:

* Definitie: Eiwitcomplexen die de structuur van chromatine veranderen, het complex van DNA en eiwitten die chromosomen vormen.

* functie: Ze kunnen nucleosomen (de basiseenheid van chromatine) herpositioneren, DNA blootstellen aan transcriptiefactoren of meer open chromatinestructuren creëren, waardoor transcriptie kan optreden.

* Voorbeelden:

* SWI/SNF -complex: Kunnen nucleosomen langs DNA schuiven en promotorgebieden blootleggen.

* ISWI -complex: Kunnen nucleosomen verplaatsen om chromatine te verdichten of toegankelijker te maken.

4. RNA -polymerasen:

* Definitie: Enzymen die verantwoordelijk zijn voor het transcriberen van DNA naar RNA.

* functie: Ze herkennen en binden aan promoters en synthetiseren vervolgens RNA -moleculen met behulp van de DNA -sjabloon.

* Voorbeelden:

* RNA -polymerase II: Transcribeert eiwitcoderende genen.

* RNA -polymerase I: Transcribeert ribosomale RNA -genen.

* RNA -polymerase III: Transcribeert overdracht RNA -genen en kleine nucleaire RNA -genen.

5. MicroRNA's (miRNA's):

* Definitie: Kleine, niet-coderende RNA-moleculen die post-transcriptioneel genexpressie kunnen reguleren.

* functie: Ze binden aan messenger RNA (mRNA) moleculen, wat leidt tot hun afbraak of translationele repressie.

* Voorbeelden: Let-7, miR-124, miR-16.

6. Andere regulerende eiwitten:

* RNA-bindende eiwitten (RBP's): Kan binden aan RNA -moleculen en hun stabiliteit, lokalisatie en vertaling beïnvloeden.

* Lange niet-coderende RNA's (lncrnas): Kan fungeren als steigers voor eiwitcomplexen, de chromatinestructuur reguleren of transcriptie reguleren.

Sleutelpunten:

* Gensregulatie is een complex en sterk georkestreerd proces met een veelvoud aan eiwitten die samenwerken.

* De specifieke betrokken eiwitten en hun functies kunnen variëren, afhankelijk van het gereguleerde gen en het celtype.

* Veel eiwitten kunnen werken als zowel activatoren als repressoren, afhankelijk van de context.

* Genexpressie wordt constant verfijnd in reactie op interne en externe signalen, waardoor cellen zich kunnen aanpassen aan hun omgeving.