1. Mitochondria: Deze zijn verantwoordelijk voor cellulaire ademhaling en energieproductie. Ze hebben hun eigen cirkelvormige DNA -molecuul, dat los staat van het nucleaire DNA.

2. chloroplasten: Deze worden aangetroffen in plantencellen en zijn verantwoordelijk voor fotosynthese. Ze hebben ook hun eigen cirkelvormige DNA -molecuul, los van het nucleaire DNA.

Men denkt dat deze organellen afkomstig zijn van oude bacteriën die werden overspoeld door eukaryotische cellen, een theorie die bekend staat als de endosymbiotische theorie. Daarom hebben ze hun eigen DNA en ribosomen, vergelijkbaar met bacteriën.