* eiwitten als producten van genen: Eiwitten worden gecodeerd door genen en genen zijn onderhevig aan mutaties in de tijd. Deze mutaties kunnen de aminozuursequentie van een eiwit veranderen, wat op zijn beurt de structuur en functie ervan kan beïnvloeden.

* Structurele gelijkenis weerspiegelt Ancestry: Soorten die nauw verwant zijn, delen een recentere gemeenschappelijke voorouder. Dit betekent dat ze minder tijd hebben gehad om mutaties te verzamelen in hun genen, inclusief die coderen voor eiwitten. Daarom hebben hun eiwitten waarschijnlijk meer vergelijkbare structuren.

* Vergelijkende analyse: Door de eiwitstructuren van verschillende soorten te vergelijken, kunnen wetenschappers overeenkomsten en verschillen identificeren. Deze vergelijkingen kunnen evolutionaire relaties onthullen en helpen bij het bouwen van fylogenetische bomen, die diagrammen zijn die de evolutionaire geschiedenis van organismen illustreren.

Voorbeelden van hoe eiwitstructuur kan worden gebruikt als een index van verwantschap:

* Cytochrome C: Dit eiwit is betrokken bij cellulaire ademhaling en wordt gevonden in een breed scala van organismen. De aminozuursequentie van cytochroom C varieert tussen soorten, maar de algehele structuur is erg vergelijkbaar. Deze gelijkenis suggereert dat cytochrome C vroeg in de geschiedenis van het leven evolueerde en in veel verschillende lijnen is behouden.

* Hemoglobin: Dit eiwit is verantwoordelijk voor het dragen van zuurstof in het bloed. De structuur van hemoglobine is zeer vergelijkbaar bij zoogdieren, maar verschilt enigszins in andere gewervelde dieren. Dit verschil kan worden gebruikt om de evolutionaire relaties tussen verschillende gewervelde groepen af ​​te leiden.

Beperkingen:

* Convergente evolutie: Soms kunnen twee soorten vergelijkbare eiwitstructuren onafhankelijk ontwikkelen vanwege vergelijkbare omgevingsdruk. Dit wordt convergente evolutie genoemd en het kan het moeilijk maken om te bepalen of een overeenkomst te wijten is aan gedeelde afkomst of convergente evolutie.

* evolutiepercentages: Verschillende eiwitten evolueren met verschillende snelheden. Sommige eiwitten zijn meer geconserveerd dan andere, wat betekent dat ze in de loop van de tijd zeer langzaam veranderen. Dit kan het moeilijk maken om eiwitstructuren te vergelijken van soorten die zeer verre verwant zijn.

Tot slot, hoewel er beperkingen zijn, is de analyse van eiwitstructuur een krachtig hulpmiddel voor het begrijpen van evolutionaire relaties. Hoe meer vergelijkbaar is, de eiwitstructuren zijn tussen twee soorten, hoe nauwer verwant ze zijn.