* Vacuümomgeving: Elektronenmicroscopen werken in een hoog vacuüm. Dit is nodig voor de elektronen om onbelemmerd te reizen, maar het is fataal voor levende organismen. Het vacuüm zou onmiddellijk levende cellen doden.

* Voorbereiding van het monster: Elektronenmicroscopie vereist uitgebreide monsterbereiding. Dit omvat het vaststellen, uitdrogen en inbedden van het monster, dat de delicate structuren en processen van levende cellen vernietigt.

* Elektronenstraalschade: De energieke elektronenstraal die wordt gebruikt in elektronenmicroscopie kan biologische monsters beschadigen en vernietigen.

Alternatieven voor het bestuderen van levende organismen:

* Lichtmicroscopie: Lichtmicroscopie wordt gebruikt om woonmonsters te bestuderen omdat het zichtbaar licht gebruikt, wat minder schadelijk is.

* Confocale microscopie: Deze techniek maakt gebruik van lasers en fluorescerende kleurstoffen om beelden met hoge resolutie van levende cellen te maken.

* Atomic Force Microscopy (AFM): AFM kan oppervlakken op nanoschaal, inclusief levende cellen, imago maken zonder een vacuüm. AFM is echter minder veelzijdig dan elektronenmicroscopie.

Samenvattend maken de barre omstandigheden en de destructieve aard van elektronenmicroscopie het ongeschikt voor het bestuderen van levende exemplaren. Lichtmicroscopie en andere technieken zijn beter geschikt voor het observeren van levende organismen.