De oorsprong van het woord "Noggin" is een beetje onduidelijk. Hoewel we de betekenis ervan kennen (verwijzend naar het hoofd), is de specifieke oorsprong ervan onbekend. Er zijn een paar theorieën, maar niemand is definitief bewezen:

* Oude Noors: Sommigen geloven dat het kan voortkomen uit het oude Noorse woord "hǫfn" betekent "hoofd" of "schedel". Deze verbinding is logisch gezien de betekenis van het woord.

* Nederlands: Een andere mogelijkheid is dat het voortkomt uit het Nederlandse woord 'knokken', wat betekent 'kloppen'. Dit kan verbinding maken met de kwetsbaarheid van het hoofd voor kloppen.

* "Noggin" als een maat: Er is een historische vermelding van "Noggin" als een eenheid van meet voor vloeistoffen, mogelijk met betrekking tot een kleine drinkcontainer. Dit kan een apart woord zijn dat later werd geassocieerd met het hoofd.

Uiteindelijk blijft de exacte oorsprong een taalkundig mysterie. Het is echter waarschijnlijk dat het woord is geëvolueerd uit een combinatie van deze invloeden, met het gebruik ervan als een term voor het hoofd dat in de loop van de tijd het meest prominent wordt.