Bacilli zijn staafvormige prokaryoten. Ze zijn een van de drie basisvormen van prokaryoten, samen met cocci (bolvormig) en spirilla (spiraal). Bacilli worden doorgaans aangetroffen in de bodem, het water en het menselijk lichaam. Enkele veel voorkomende voorbeelden van bacillen zijn:

* Escherichia coli (E. coli)

* Bacillus subtilis

* Pseudomonas aeruginosa

*Streptococcus pneumoniae

* Staphylococcus aureus

Bacilli kunnen zowel Gram-positief als Gram-negatief zijn. Gram-positieve bacillen hebben een dikke celwand gemaakt van peptidoglycaan, terwijl Gram-negatieve bacillen een dunne celwand hebben gemaakt van lipopolysachariden.