Wetenschappers hebben een nieuwe techniek ontwikkeld om de interacties tussen RNA en chromatine in het genoom in kaart te brengen. Deze techniek, genaamd ChIRP-nexus (Chromatin Isolation by RNA Purification gevolgd door Nexus-analyse), biedt een uitgebreid beeld van hoe RNA-moleculen interageren met DNA en eiwitten in de kern.

De onderzoekers gebruikten ChIRP-nexus om de interacties tussen RNA en chromatine in menselijke cellen te bestuderen. Ze ontdekten dat RNA-moleculen interageren met een breed scala aan chromatineregio's, waaronder genpromoters, versterkers en geluiddempers. Deze interacties spelen een cruciale rol bij genregulatie, omdat ze de toegankelijkheid van DNA voor transcriptiefactoren en andere eiwitten kunnen controleren.

"Onze methode is een uiterst gevoelig en veelzijdig platform voor de mondiale analyse van RNA-chromatine-interacties", zegt senior auteur Dr. Chuan He van de Universiteit van Chicago. "Het kan RNA-bindende eiwitten op een genoombrede en onbevooroordeelde manier identificeren, en de resultaten kunnen worden toegepast om de mechanismen van genregulatie beter te begrijpen en nieuwe therapeutische strategieën voor verschillende ziekten te ontwikkelen."

ChIRP-nexus is een krachtig nieuw hulpmiddel dat wetenschappers zal helpen beter te begrijpen hoe RNA-moleculen interageren met chromatine in het genoom. Deze informatie zal essentieel zijn voor het begrijpen van genregulatie en het ontwikkelen van nieuwe therapeutische strategieën voor een breed scala aan ziekten.