De Marianentrog is het diepste deel van de oceanen van de aarde, met een maximaal bekende diepte van ongeveer 11.034 meter (36.201 voet). De extreme druk, kou en duisternis van de loopgraaf maken het tot een uiterst uitdagende omgeving voor het leven om te overleven. Er zijn echter een aantal organismen gevonden die in de Marianentrog leven, waaronder de slakkenvis, die het record heeft van de diepst levende vis die ooit is gevonden.

Sequentiebepaling van het slakkenvisgenoom

Een team onderzoekers van de Universiteit van Washington heeft het genoom van de slakvis (Pseudoliparis swirei) in kaart gebracht om beter te begrijpen hoe deze zich heeft aangepast aan het leven in zulke extreme omstandigheden. Het slakkenvisgenoom bleek een aantal genen te bevatten die betrokken zijn bij DNA-reparatie, eiwitvouwing en cellulair metabolisme. Er wordt aangenomen dat deze genen de slakkenvis helpen de hoge druk, kou en duisternis van de Marianentrog te overleven.

Belangrijkste bevindingen

Enkele van de belangrijkste bevindingen uit het onderzoek zijn onder meer:

1. Het genoom van de slakvis is relatief klein, met slechts ongeveer 600 miljoen basenparen. Dit is ongeveer een vijfde van de omvang van het menselijk genoom.

2. Het slakkenvisgenoom bevat een aantal genen die betrokken zijn bij DNA-reparatie, eiwitvouwing en cellulair metabolisme. Er wordt aangenomen dat deze genen de slakkenvis helpen de hoge druk, kou en duisternis van de Marianentrog te overleven.

3. Het slakkenvisgenoom bevat ook een aantal genen die betrokken zijn bij de productie van antivrieseiwitten. Deze eiwitten helpen voorkomen dat de lichaamsvloeistoffen van de slakkenvis bevriezen bij de koude temperaturen van de Marianentrog.

Conclusie

De sequentiebepaling van het genoom van de slakkenvis heeft waardevolle inzichten opgeleverd over hoe dit opmerkelijke wezen zich heeft aangepast aan het leven in de extreme omstandigheden van de Marianentrog. Dit onderzoek kan ook implicaties hebben voor het begrijpen hoe andere organismen overleven in extreme omgevingen.