In het afgelopen decennium hebben wetenschappers honderden nieuwe virussen beschreven met het potentieel om tussen dieren in het wild en mensen over te gaan. Maar hoe kunnen ze weten welke het meest risicovol zijn voor spillover en dus welke prioriteit moeten krijgen voor verder toezicht op mensen?

Wetenschappers van de University of California, Davis hebben netwerkgebaseerde modellen gemaakt om prioriteit te geven aan nieuwe en bekende virussen vanwege hun risico op zoönotische overdracht, dat is wanneer infectieziekten tussen dieren en mensen overgaan.

Hun studie, gepubliceerd in het tijdschrift Communications Biology , levert verder bewijs dat coronavirussen het meest risicovol zijn voor overloop en prioriteit moeten blijven krijgen voor verbeterd toezicht en onderzoek.

De machine learning-modellen zijn ontworpen door het EpiCenter for Disease Dynamics van het UC Davis One Health Institute in de School of Veterinary Medicine.

Prioriteit geven aan nieuwe virussen

Uit de modellen bleek dat nieuwe virussen uit de coronavirusfamilie naar verwachting een groter aantal soorten als gastheren zullen hebben. Dit komt overeen met bekende virussen, wat aangeeft dat deze familie van virussen de hoogste prioriteit moet krijgen voor surveillance.

De wetenschappers hebben voor elk virus een prioriteitsscore gemaakt om als maatstaf te dienen voor het risico op zoönotische overdracht.

"Naarmate de surveillance toeneemt, hopen we overspoeld te worden met gegevens die verband houden met virussen", zegt hoofdauteur en veterinaire epidemioloog Pranav Pandit, een onderzoeker bij het UC Davis One Health Institute. "Deze tools zullen ons helpen het risico van nieuwe virussen te begrijpen, wat kan helpen bij de voorbereiding op toekomstige pandemieën."

Omgevingsverandering en virale connecties

Het model maakt gebruik van een datagestuurd, virus-hostnetwerk om de waarschijnlijkheid te kwantificeren dat de mens gastheer is voor meer dan 500 nieuw ontdekte virussen tussen 2009 en 2019. onderzoekers.

Gastheer-pathogeennetwerken bieden inzicht in de ecologie van virussen en hun gastheren, wat van cruciaal belang is voor het begrijpen van het risico dat dergelijke virussen vormen voor de menselijke gezondheid. Dit is vooral belangrijk in een veranderend klimaat en milieu. Naarmate het landschap verandert en soorten als reactie daarop verschuiven en bewegen, kan het risico van virale overdracht tussen soorten toenemen.

"Deze studie laat zien hoe verschillende diersoorten met elkaar verbonden zijn door de virussen die ze delen", zegt de corresponderende auteur Christine Johnson, een UC Davis hoogleraar epidemiologie en ecosysteemgezondheid en directeur van het EpiCenter for Disease Dynamics. "Verandering van het milieu is een enorme drijfveer voor het verplaatsen van soorten. Hoe virussen omgaan met verschillende gastheren in een veranderende omgeving is van cruciaal belang om het risico te begrijpen dat ze vormen voor de menselijke gezondheid."

Hoge prioriteiten

Naast coronavirussen, rangschikte het model ook verschillende paramyxovirussen als hoge prioriteiten voor toekomstig werk. Ziekten die verband houden met deze familie van virussen zijn onder meer mazelen, bof en luchtweginfecties.

"Het karakteriseren van honderden virussen kost veel tijd en vereist prioritering", zei Pandit. "Onze netwerkgebaseerde aanpak helpt bij het identificeren van de vroege signalen in de ecologische en evolutionaire trajecten van deze virussen. Het kan ook helpen ontbrekende schakels tussen virussen en hun gastheren te verlichten." + Verder verkennen

Nieuwe web-app rangschikt overlooprisico voor nieuw gedetecteerde virussen