science >> Wetenschap >  >> Biologie

Hoe een tRNA-sequentie uit een DNA-sequentie te krijgen

Het proces van het produceren van eiwit uit een DNA-deoxyribonucleïnezuursequentie omvat twee hoofdstappen: transcriptie en translatie. Tijdens transcriptie wordt een boodschapper-ribonucleïnezuur of mRNA gecreëerd uit de DNA-matrijs. Dit mRNA combineert met een ribosomaal RNA, bekend als rRNA, en transfer-RNA, of tRNA, complex om de mRNA-code te vertalen in een aminozuursequentie, een eiwit. DNA bestaat uit een reeks nucleotide basen. De vier basen zijn adenine, thymine, guanine en cytosine. De volgorde waarin deze basen op een DNA-streng voorkomen codeert uiteindelijk voor de productie van bepaalde eiwitten. Nadat de cellen de eiwitten hebben geproduceerd, kunnen ze structureel of in verschillende metabolische processen worden gebruikt.

Creëer een mRNA-transcript van de DNA-sequentie. Elke base in DNA komt overeen met een andere base. Foto's van DNA tonen het typisch in een dubbele helix, waarbij de basen op één streng via bindingen verbinden met de complementaire basen op de tegenoverliggende streng. Complementaire basen zijn: adenine (A) en thymine (T) en cytosine (C) en guanine (G). Dus als één DNA-streng A-C-G-C-T-A leest, dan is de complementaire streng T-G-C-G-A-T. Je kunt de sequentie van het mRNA-transcript op dezelfde manier vinden door de complementen van de basen die in de DNA-sequentie worden getoond te gebruiken. RNA bevat echter niet de basisthymine (T); in plaats daarvan wordt deze basis vervangen door uracil (U). Wanneer je een adenine (A) tegenkomt in de DNA-sequentie, match het met een uracil (U).

Als de DNA-sequentie AATCGCTTACGA is, dan is de mRNA-sequentie UUAGCGAAUGCU.

Creëer een tRNA-anti-codonsequentie van het mRNA-transcript. Elk tRNA heeft een reeks van drie basen daarop bekend als een anti-codon. Het anti-codon komt overeen met complementaire basen in de mRNA-sequentie. Om de algehele anti-codonsequentie die overeenkomt met een streng van mRNA te bepalen, eenvoudig de RNA-sequentie opnieuw transcriberen; met andere woorden, schrijf de complementaire bases op. Met behulp van de eerder genoteerde mRNA-sequentie is de anti-codonsequentie van tRNA A-A-T-C-G-C-U-A-C-G-A.

Verbreek de door u gevonden tRNA-sequentie in sets van drie basen. Omdat anti-codons uit drie basen tegelijk bestaan, is een betere manier om de anti-codonsequentie te schrijven AATCGC-UUACGA AAT-CGC-UUA-CGA.

TL; DR (Te lang; Didn Lees niet)

Je kunt de anti-codonsequentie nog sneller vinden door simpelweg de DNA-sequentie te schrijven, door U voor uracil te gebruiken in plaats van T voor thymine. Splits vervolgens de sequentie in de drie base-anti-codons.

U kunt de anti-codonsequentie gebruiken om overeen te komen met de eiwitten die door elk tRNA tijdens de translatie zijn toegevoegd, waardoor een aminozuursequentie wordt gecreëerd. Controleer echter of de referentiediagram voor aminozuren die u gebruikt, voor anti-codons is (zie bronnen). Veel aminozuursequentiediagrammen geven eenvoudigweg de overeenkomende mRNA-codons weer in plaats van tRNA-anticodons, waardoor u de stap van het bepalen van de anti-codonsequentie kunt overslaan.

De sequentie van het tRNA-molecuul is gewoon een RNA-transcriptie van de DNA-sequentie die is gebruikt om het te maken.