Om te herdenken dat het Wellcom Trust Sanger Institute in 2018 25 jaar werd, het Instituut en zijn medewerkers sequensen 25 nieuwe genomen van soorten in het VK. De laatste vijf soorten zijn nu gekozen door duizenden schoolkinderen en leden van het publiek over de hele wereld, die hebben deelgenomen aan de online stemming van het 25 Genomes Project.

Het project zou kunnen onthullen waarom sommige beekforellen naar de open oceaan migreren, terwijl anderen dat niet doen, of vertel ons meer over de magneto-receptoren in de ogen van roodborstjes waarmee ze de magnetische velden van de aarde kunnen 'zien'. Het zou ook licht kunnen werpen op waarom rode eekhoorns kwetsbaar zijn voor het eekhoornpokkenvirus, toch kunnen grijze eekhoorns het virus dragen en verspreiden zonder ziek te worden.

Alle resultaten zullen openbaar worden gemaakt en zullen leiden tot toekomstige studies om de biodiversiteit van het VK te begrijpen en het behoud en begrip van deze soorten te helpen.

Het Sanger Institute werd in 1993 opgericht door professor Sir John Sulston als onderdeel van het Human Genome Project. Het Instituut leverde de grootste afzonderlijke bijdrage aan de gouden standaardsequentie van het eerste menselijke genoom, die in 2003 werd gepubliceerd.

Een genoom is de complete set genetische instructies van een organisme, geschreven in DNA. Elk genoom bevat alle informatie die nodig is om dat organisme te bouwen en te laten groeien en ontwikkelen.

Sinds de mijlpaal voltooiing van het menselijk genoom, het Sanger Institute is uitgegroeid tot een wereldwijd erkende leider op het gebied van genomics. Van veel meer belangrijke referentiegenomen is al de sequentie bepaald - van het genoom van muizen en zebravissen tot het varken, gorilla, mug en vele anderen. Naast diersoorten, infectieziekten en bacteriën staan ​​ook prominent op de lijst van referentiegenomen, van salmonella en MRSA tot chlamydia en malaria. Al deze hebben belangrijke inzichten opgeleverd over deze soorten in gezondheid en ziekte.

Nutsvoorzieningen, het Sanger Institute en zijn partners sequensen uitgebreid 25 soorten uit het VK. Dit project is een kleine bijdrage aan een veel grotere onderneming, waar wetenschappers van over de hele wereld samenkomen om een ​​plan te vormen om al het leven op aarde in kaart te brengen.

Dit project is mogelijk gemaakt door PacBio® long-read sequencing-technologie, die hoogwaardige genomen genereert. Het Instituut werkt samen met PacBio en andere leiders in de technologiesector, 10x Genomics en Illumina, om de meest uitgebreide weergave van deze genomen te creëren.

De hoogwaardige genomen zullen deuren openen voor wetenschappers om deze informatie te gebruiken, en onderzoekers zouden kunnen ontdekken hoe Britse soorten reageren op milieudruk, en welke geheimen ze in hun genetica hebben waardoor ze kunnen floreren, of bot.

De 25 soorten zijn onderverdeeld in vijf categorieën, afhankelijk van de eigenschappen die ze delen:Bloeiend, soorten in opkomst in het VK; spartelen, bedreigde en afnemende soorten; Gevaarlijk, invasieve en schadelijke soorten; Iconisch, typisch Britse soorten die we allemaal herkennen; cryptisch, soorten die uit het zicht zijn of niet te onderscheiden zijn van anderen alleen op basis van uiterlijk.

De 25 soorten waarvan hun genomen worden gesequenced zijn:

Bloeiende soorten:

• Grijze Eekhoorn
• Ringlet vlinder
• Roesel's Bush-Cricket
• Oxford kruiskruid

Spartelende soorten:

• Rode eekhoorn
• Water woelmuis
• Tortelduif
• Noordelijke Februari Rode Steenvlieg

Gevaarlijke soorten:

• Reuzenberenklauw
• Indiase balsem
• Koning Sint-jakobsschelp, ook bekend als Grote Sint-jakobsschelp, Coquilles Saint-Jacques
• Nieuw-Zeelandse platworm

Iconische soorten:

• gouden arend
• braambes
• Europese Robin
• Rode Mason Bee

Cryptische soorten:

• bruine forel
• Gewone dwergvleermuis
• Carrington's Featherwort
• Zomertruffel

Vijf soorten gekozen door het publiek:

• Gewone zeester
• Fen Raft Spider
• Kleine gevlekte kathaai
• Aziatische horzel
• Euraziatische Otter

Professor Sir Mike Stratton, directeur van het Wellcom Trust Sanger Institute, zei:"Vijfentwintig jaar geleden was het gebied van genomics een ontluikend idee en de implicaties ervan konden alleen worden gedroomd. Tegenwoordig is de realiteit van genomics en biodata dat het ons begrip transformeert, diagnose, en behandeling van ziekten, variërend van kanker en hartziekten tot malaria en infecties. De wetenschap en technologie die dit tijdperk van ontdekkingen aansturen, versnellen ons begrip van het menselijk lichaam, maar ook van de wereld om ons heen.

Dit project is tot stand gekomen na vele doordachte gesprekken over de hele wereld met betrekking tot hoeveel van de soorten op onze planeet in de komende decennia zouden kunnen worden gesequenced - in principe, allemaal. We beginnen aan onze bijdrage aan het in kaart brengen van al het leven op aarde."

Dokter Julia Wilson, Associate Director van het Wellcom Trust Sanger Institute, zei:"Door deze 25 genomen te sequencen, wetenschappers zullen een beter begrip krijgen van Britse soorten, hoe ze hier zijn gekomen, hun evolutie, en hoe verschillende soorten zich aanpassen aan een veranderende omgeving. De resultaten kunnen verborgen waarheden in deze soorten aan het licht brengen, en zal de wetenschappelijke gemeenschap in staat stellen te begrijpen hoe onze wereld voortdurend verandert en om ons heen evolueert. Het 25-jarig bestaan ​​van het Sanger Instituut willen we op een bijzondere 'Sanger' manier vieren, en ik ben opgewonden om te zien hoe het 25 Genomes Project zich ontvouwt."

Ken Skeldon, Head of Public Engagement op de Wellcome Genome Campus, zei:"Door het publiek de kans te geven om te kiezen van welke soorten hun genomen worden gesequenced in het 25 Genomes Project, heeft het project nieuwe perspectieven gebracht. We zijn verheugd te zien dat zoveel mensen en schoolkinderen in het VK en daarbuiten actief betrokken zijn geweest bij online chats met de wetenschappers en gestemd voor de laatste vijf soorten."

Tim Littlewood, Head of Life Sciences van het Natural History Museum zei:"Het Natural History Museum is er trots op samen te werken met het Sanger Institute om hun 25e verjaardag te vieren en ook om de vooruitgang te vieren die moleculaire technieken zoals genoomsequencing kunnen brengen in de studie van het VK dieren in het wild. De 80 miljoen exemplaren waar we voor zorgen, van overal op de wereld, beschikken over een schat aan genetische informatie die ons in staat stelt innovatief onderzoek te doen, mondiale uitdagingen aan te pakken. Een focus op de Britse biodiversiteit met geavanceerde technologie is bijzonder welkom."