* Samengestelde microscopen gebruiken twee lenzen, een objectieflens en een oculairlens, om kleine objecten te vergroten. De objectieflens verzamelt licht van het object en focust dit op de oculairlens. De oculairlens vergroot vervolgens het beeld van het object.

* Eenvoudige microscopen gebruiken slechts één lens, de objectieflens, om kleine voorwerpen te vergroten.

Elektronenmicroscopen

* Transmissie-elektronenmicroscopen (TEM's) gebruiken een elektronenbundel om door een dun monster van het object te gaan. De elektronen interageren met de atomen in het monster en het resulterende beeld wordt vergroot.

* Scanning-elektronenmicroscopen (SEM's) gebruiken een elektronenbundel om het oppervlak van het object te scannen. De elektronen interageren met de atomen op het oppervlak en het resulterende beeld wordt vergroot.

Scanningsondemicroscopen

* Scanning-tunnelingmicroscopen (STM's) gebruiken een scherpe metalen sonde om het oppervlak van het object te scannen. De sonde beweegt heen en weer over het oppervlak en het resulterende beeld wordt vergroot.

* Atoomkrachtmicroscopen (AFM's) gebruiken een scherpe cantilever met een punt aan het uiteinde om het oppervlak van het object te scannen. De cantilever beweegt heen en weer over het oppervlak en het resulterende beeld wordt vergroot.

Andere soorten microscopen

* Fluorescentiemicroscopen gebruiken een fluorescerende kleurstof om het object te kleuren. De kleurstof straalt licht uit wanneer deze wordt blootgesteld aan licht van een bepaalde golflengte, en het resulterende beeld wordt vergroot.

* Confocale microscopen gebruiken een gerichte lichtstraal om het object te verlichten. Het licht wordt gedetecteerd door een sensor en het resulterende beeld wordt vergroot.

* Multiphoton-microscopen gebruiken twee of meer fotonen om de elektronen in het object te exciteren. Het resulterende beeld wordt vergroot.