science >> Wetenschap >  >> Chemie

Hoe het iso-elektrische punt van peptiden te berekenen

Peptiden zijn korte polymeerfragmenten samengesteld uit aminozuren. Elk peptide heeft een bepaalde aminozuursequentie aangegeven met een drieletterige of eenletterige code; het aminozuur alanine wordt bijvoorbeeld afgekort als "Ala" of "A." De lading van de peptiden in de oplossing hangt af van de zuurtegraad van de oplossing. Het isoelektrische punt (pI) verwijst naar de zuurgraad van de oplossing waarbij het peptidemolecuul de netto lading van nul heeft. De oplosbaarheid van het peptide is minimaal op het isoelektrische punt. Gebruik beschikbare webservers om de pI-waarde voor een peptide-aminozuursequentie te berekenen.

Schrijf de peptidesequentie op basis van de éénletterige code. Als een peptide bijvoorbeeld een aminozuursequentie Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine-Serine-Glumatisch zuur-Leucine-Proline) heeft, dan is de sequentie van één letter "ASELP." Raadpleeg indien nodig de drieletterige conversietabel van één letter in Resources.

Gebruik elke webbrowser, Internet Explorer of Firefox om bijvoorbeeld naar een server te navigeren die het peptide-iso-elektrisch punt (pI) berekent; zie bronnen.

Voer de één-letterige sequentie van het peptide - "ASELP" in ons voorbeeld - in het vak in en klik op "Compute".

Lees de waarde van het iso-elektrische punt (pI) in de regel "Theoretische pI /Mw." In ons voorbeeld is de pI 4,00. Merk op dat de server ook het molecuulgewicht (Mw) van het peptide berekent.