Een biochemicus van Purdue University heeft een nieuwe methode ontwikkeld voor het detecteren van bepaalde soorten eiwitten die dienen als indicatoren voor kanker en andere ziekten.

Glycoproteïnen worden gevormd wanneer suikers zich hechten aan een eiwit en dit wijzigen. In sommige gevallen, een combinatie van glycoproteïnen in een bloed- of urinemonster kan een aanwijzing zijn voor ziekte of kanker.

Maar die glycoproteïnen kunnen ongrijpbaar zijn. Er is geen antilichaam om onderscheid te maken tussen hen en reguliere eiwitten. En de complexe en omvangrijke suikergroepen kunnen het zelfs voor standaard eiwitdetectie-antilichamen moeilijk maken om hun doelwitten te vinden.

W. Andy Tao, een Purdue hoogleraar biochemie, heeft een nieuwe eiwitreeks ontwikkeld, een platform met hoge doorvoer om meerdere eiwitten parallel te analyseren, voor het scheiden van glycoproteïnen van ongemodificeerde eiwitten. Tao toonde ook zijn effectiviteit aan voor het identificeren van glycoproteïnen die geassocieerd zijn met blaaskanker. De bevindingen werden maandag (14 november) gepubliceerd in de Tijdschrift van de American Chemical Society .

Tao ontwikkelde een polymeer van nanoformaat, genaamd polyGPA, dat zich hecht aan de suikergroepen van glycoproteïnen en deze naar het oppervlak van de eiwitarray brengt. Het nanopolymeer herpositioneert ook het glycoproteïne, zodat de antilichamen die worden gebruikt om ongemodificeerde eiwitten te detecteren, hun doelen beter kunnen bereiken.

"Er zijn veel soorten suiker en combinaties. Suikermodificatie kan een zeer belangrijke indicatie zijn van de ziektetoestand, " zei Tao. "Een panel van eiwitten die door suikers zijn gemodificeerd, kan een aanwijzing zijn voor een bepaalde ziekte."

Tao zei dat tests aantoonden dat zijn methode 17 keer tot 25 keer meer kans heeft om eiwitten te identificeren die anders zouden zijn gemist in reguliere testprocedures. Hij was ook in staat om glycoproteïnen te identificeren die verband houden met blaaskanker in een urinemonster.

"Het is mogelijk om ons platform te gebruiken om deze met suiker gemodificeerde eiwitten te identificeren als een biomarker voor blaaskanker, ' zei Tao.

Tao zal werken aan het commercialiseren van zijn nanopolymeer-gemodificeerde eiwitarray via zijn bedrijf, Timora analytische operaties, die actief is in het Purdue University Research Park. Het bedrijf maakt het pIMAGO nanopolymeer, die kan worden gebruikt om te bepalen of geneesmiddelen tegen kanker effectief zijn geweest tegen biochemische processen die kunnen leiden tot de vorming van kankercellen, en polyMAC, een nanopolymeer dat wetenschappers helpt bij het ophalen en bestuderen van eiwitten die processen ondergaan die verband houden met de vorming van kankercellen.