science >> Wetenschap >  >> anders

Datamining-aanpak onthult dat samenwerking de sleutel is voor farmaceutische doorbraken

De bovenstaande afbeelding, Afb. 2 van het papier, werd gegenereerd met behulp van Cytoscape, een Open Source-tool gefinancierd door het Amerikaanse National Institute of Health (NIH). Krediet:Elsevier

Fundamenteel onderzoek kan leiden tot genezing, drugs en andere wetenschappelijke doorbraken door samenwerking, bevestigt een nieuwe studie in Heliyon (www.heliyon.com/). Inzicht in de omvang van de samenwerking die tot doorbraken leidt, kan onderzoeksinstellingen helpen bij het plannen en evalueren van hun eigen samenwerkingsinspanningen.

De auteurs van de nieuwe studie, van NET ESOLUTIES Corporation (NETE), Gladstone-instituten, UCSF, en Elsevier, combineerde datamining met ouderwetse detectivetechnieken om te begrijpen wat leidde tot de ontwikkeling van vijf belangrijke geneesmiddelen tegen kanker. Hun resultaten laten zien hoe onderzoekssamenwerking, subsidies en publicaties gecombineerd om de medicijnen mogelijk te maken.

"Ik denk dat ons werk ons ​​eraan herinnert dat fundamentele wetenschap deze doorbraken in de vertaling voorafging en beïnvloedde door middel van samenwerking, " zei de corresponderende auteur Dr. George Chacko van NETE. "Overheidsfinanciering van fundamenteel onderzoek heeft veel translationele voordelen; de inherente collaboratieve aard van wetenschappelijke ontdekking leidt tot doorbraken."

In de studie, de onderzoekers gebruikten geneesmiddelen tegen kanker als casestudies voor hun methodologie. Ze dataminden openbare en commerciële gegevensbronnen, waaronder:klinische proeven; Food and Drug Administration (FDA) documenten; octrooiaanvragen; subsidieaanvragen; en peer-reviewed artikelen over Scopus (www.scopus.com/home.uri) en PubMed.

Om de geschiedenis van de ontwikkeling van vijf geneesmiddelen in kaart te brengen - Imatinib, Sunitinib, nelarabine, Ramucirumab en Alemtuzumab (Campath) - het team identificeerde meer dan 235 onderzoekers in vijf grote netwerken, die gezamenlijk 106 produceerden, 000 peer-reviewed artikelen. Ze analyseerden citaten om een ​​kernset van publicaties te identificeren die in alle netwerken werden geciteerd, waaronder 14 publicaties die alle vijf de netwerken gemeen hadden.

"We waren verrast (en verheugd) door het kleine aantal geciteerde publicaties dat de samenwerkingsnetwerken gemeen hadden, en verrast om te ontdekken hoe invloedrijk ze waren bij het vormgeven van toekomstig denken, " merkte Dr. Chacko op..

De onderzoekers zeggen dat hun nieuwe aanpak gemakkelijk kan worden aangepast en uitgebreid naar andere gebieden. Het kan worden gebruikt om de zeer grote wetenschappelijke samenwerkingen te documenteren die gedurende vele jaren plaatsvinden en die zich uitstrekken over fundamenteel tot translationeel onderzoek, onthullen hoe samenwerking resulteert in ontdekking en innovatie die het publiek ten goede komt.

Echter, de auteurs voegen twee waarschuwingen toe. bibliometrie, centraal in de studie, heeft beperkingen vanwege verschillende citatiepraktijken in verschillende disciplines en vanwege de gegevenskwaliteit. Ten tweede, het team was niet in staat om toegang te krijgen tot de volledige financiering en peer review-records.

"Voor ons, dit document is een stap in de richting van het grotere doel om input in de wetenschap te documenteren en in kaart te brengen in output en resultaten. Studies als deze maken een grotere toegankelijkheid en transparantie mogelijk en maken grootschalig werk mogelijk. Digitale methoden zullen blijven zorgen voor meer transparantie en betere evaluatiewetenschap, "zei Dr. Chacko.

De studie zelf is het resultaat van een succesvolle interinstitutionele samenwerking - een samenwerking die het team een ​​jaar kostte om op te bouwen.

"We hebben geluk met zulke goede medewerkers, " Dr. Chacko voegde toe. "De NETE-component van deze samenwerking was een niet-gefinancierd gedachte-experiment dat buiten kantooruren werd uitgevoerd - 's avonds, nachten en in het weekend. We hebben nu wat geld om dit werk uit te breiden, dat is erg nuttig en ik ben NETE dankbaar voor het ondersteunen van deze ideeën."