De menselijke activiteit die het meest negatieve effect heeft op de stabiliteit van een meermilieu is eutrofiëring, de verrijking van een waterlichaam met voedingsstoffen, vooral stikstof en fosfor. Deze voedingsstoffen kunnen afkomstig zijn uit verschillende bronnen, waaronder afvoer uit de landbouw, rioolwaterafvoer en industrieel afvalwater. Eutrofiëring kan leiden tot algenbloei, waardoor zonlicht de onderwaterplanten niet kan bereiken en de hoeveelheid zuurstof in het water kan verminderen. Dit kan een negatief effect hebben op het hele ecosysteem van het meer, inclusief vissen, amfibieën en ongewervelde dieren. Bovendien kan eutrofiëring ook leiden tot de ophoping van giftige chemicaliën in het water, wat een gezondheidsrisico kan vormen voor mens en dier.