Voordat ze eDNA gebruiken voor de detectie van invasieve soorten, moeten de onderzoekers eerst de doelsoort selecteren waarnaar ze op zoek zijn en referentiemonsters verzamelen. Dit omvat het verkrijgen van bekende DNA-monsters van de invasieve soort van belang. De referentiemonsters zijn cruciaal voor het creëren van een eDNA-referentiedatabase, die zal worden gebruikt om te vergelijken met het eDNA dat uit de waterweg wordt verzameld. Het beschikken over nauwkeurige en representatieve referentiemonsters is een cruciale stap bij het waarborgen van de effectiviteit en specificiteit van eDNA-surveillance voor de invasieve doelsoort.