Lagunes hebben doorgaans een of meer beperkte verbindingen met de oceaan, ook wel inhammen genoemd. De grens van een lagune wordt gewoonlijk bepaald door het omringende land, inclusief eventuele eilanden of zandbanken die bij de inham aanwezig kunnen zijn. Bovendien kan de grens ook worden bepaald door de diepte van het water, aangezien lagunes vaak ondiepe watermassa's zijn. De grens van een lagune kan ook worden bepaald door de soorten planten en dieren die erin leven. Sommige lagunes kunnen bijvoorbeeld de thuisbasis zijn van mangroven of zeegrassen, terwijl andere de thuisbasis zijn van koraalriffen.