Hoewel arginine een zeer eenvoudig aminozuur is, is het technisch gezien niet het "meest basale" aminozuur. lysine wordt over het algemeen beschouwd als het meest basale aminozuur vanwege de PKA -waarde.

Dit is waarom:

* PKA -waarden: De PKA -waarde is een maat voor hoe gemakkelijk een molecuul een proton doneert (H+). Een lagere PKA geeft een sterker zuur aan, terwijl een hogere PKA een sterkere basis aangeeft.

* Lysine's PKA: De aminogroep van de zijketen van lysine heeft een PKA van ongeveer 10,5, waardoor het een relatief sterke basis is.

* Arginine's PKA: De guanidino -groep arginine heeft een PKA van ongeveer 12.5. Hoewel dit hoger is dan Lysine's PKA, is het belangrijk op te merken dat de PKA van de Guanidino -groep wordt beïnvloed door zijn resonantiestructuren, waardoor het een zwakkere basis is dan de eenvoudige aminogroep van lysine.

Daarom maken Lysine's hogere PKA en zijn eenvoudigere aminogroep het een sterkere basis dan arginine.

Zowel arginine als lysine worden echter beschouwd als basisaminozuren vanwege de aanwezigheid van hun positief geladen zijketens bij fysiologische pH.