Ether is een licht ontvlambaar en vluchtig oplosmiddel en het gebruik van zuigfiltratie met ether kan een gevaarlijke situatie creëren vanwege het risico op ontsteking. De zuigkracht die tijdens het filteren wordt uitgeoefend, kan statische elektriciteit veroorzaken, waardoor de etherdampen kunnen ontbranden. Bovendien kunnen etherdampen bij blootstelling aan lucht en licht explosieve peroxiden vormen.

In plaats van zuigfiltratie moeten andere methoden, zoals zwaartekrachtfiltratie of filtratie met behulp van een Büchner-trechter met filtreerpapier, worden overwogen voor oplossingen die ether bevatten. Deze methoden maken geen gebruik van afzuiging en zijn daarom veiliger voor brandbare oplosmiddelen zoals ether.