Bij de titratie van natriumthiosulfaat met jodium treedt de kleurverandering op als gevolg van de reactie tussen deze twee stoffen. Het eindpunt van de titratie wordt bereikt wanneer al het thiosulfaat heeft gereageerd met jodium. Op dit punt zal de oplossing kleurloos zijn. Als er echter meer jodium wordt toegevoegd nadat het eindpunt is bereikt, wordt de oplossing blauw door de vorming van trijodide-ionen.

De reactie tussen thiosulfaat en jodium kan worden weergegeven door de volgende vergelijking:

2S2O3^2- + I2 → S4O6^2- + 2I^-

Op het eindpunt van de titratie is al het thiosulfaat met het jodium gereageerd, waardoor er geen S2O3^2-ionen meer in de oplossing aanwezig zijn. Dit betekent dat eventueel extra toegevoegd jodium niet zal reageren met het thiosulfaat en in plaats daarvan als I2-moleculen in oplossing zal blijven. Deze I2-moleculen absorberen licht in het zichtbare spectrum, waardoor de oplossing een blauwe kleur krijgt.

De vorming van trijodide-ionen kan worden weergegeven door de volgende vergelijking:

I2 + I- → I3^-

De I3-ionen zijn ook verantwoordelijk voor de blauwe kleur van de oplossing.