HPLC biedt een snelle, geautomatiseerde en zeer nauwkeurige methode om bepaalde chemische componenten in een monster te identificeren, maar het kan duur, complex zijn en werkt niet voor alle monsters. Medische, forensische, milieu- en productielaboratoria gebruiken de techniek om de chemicaliën in een monster te kwantificeren en te scheiden. HPLC heeft zowel voor- als nadelen in vergelijking met andere technieken.
HPLC en vergelijkbare technieken

Net als andere vormen van chromatografie maakt HPLC de scheiding van chemische bestanddelen mogelijk door het gebruik van een mobiele fase en een stationaire fase. De mobiele fase is vloeibaar en de stationaire fase is vast. Omdat de verschillende componenten met verschillende snelheden bewegen, scheiden ze van elkaar. Alternatieve technieken omvatten capillaire elektroforese, waarbij stoffen door oplossingen in een elektrisch veld migreren, en andere chromatografische methoden zoals vaste-fase-extractie, gaschromatografie en dunnelaagchromatografie.
Snelheid, efficiëntie en nauwkeurigheid

in vergelijking met andere chromatografische technieken, zoals TLC, HPLC is extreem snel en efficiënt. Het maakt gebruik van een pomp in plaats van de zwaartekracht om een vloeibaar oplosmiddel door een vast adsorberend materiaal te persen, waarbij verschillende chemische componenten zich scheiden terwijl ze met verschillende snelheden bewegen. Het proces kan in ongeveer 10 tot 30 minuten worden voltooid en levert een hoge resolutie. Het is nauwkeurig en zeer reproduceerbaar. Omdat het grotendeels geautomatiseerd is, kunnen basis-HPLC-runs worden uitgevoerd met minimale training.
Kosten en complexiteit

Ondanks zijn voordelen kan HPLC kostbaar zijn en grote hoeveelheden dure organische stoffen vereisen. Technieken zoals vaste-fase-extractie en capillaire elektroforese kunnen goedkoper en zelfs sneller zijn, vooral voor analyse onder goede fabricagepraktijken. Hoewel het relatief eenvoudig is om bestaande HPLC-methoden te gebruiken, kan het complex zijn om problemen op te lossen of nieuwe methoden te ontwikkelen. Dit komt grotendeels door de reeks verschillende modules, kolommen en mobiele fasen.
Gevoeligheid en resolutie

Over het algemeen is HPLC veelzijdig en uiterst nauwkeurig als het gaat om het identificeren en kwantificeren van chemische componenten. Met veel stappen is de precisie van HPLC grotendeels te danken aan het geautomatiseerde en daarom zeer reproduceerbare proces. HPLC heeft een lage gevoeligheid voor bepaalde verbindingen en sommige kunnen niet worden gedetecteerd omdat ze onomkeerbaar worden geadsorbeerd. Vluchtige stoffen worden beter gescheiden door gaschromatografie