Skoltech-onderzoekers onderzochten de antibiotische verbindingen die een 'Trojaans paard'-strategie gebruiken om in een niet-herkende bacteriële cel te komen en de synthese van eiwitten te voorkomen, uiteindelijk de cel doden. Ze waren in staat om nieuwe genclusters te identificeren die lijken op die van bekende 'Trojaanse paarden' - deze sturen waarschijnlijk de biosynthese van nieuwe antimicrobiële stoffen die verder onderzoek vereisen. De review paper is gepubliceerd in het tijdschrift RSC Chemische Biologie .

Als het gaat om antimicrobiële aanvallen, het moeilijkste is om de formidabele buitenste verdedigingswerken te doorbreken:het kan lastig zijn om in een doelcel te komen om het dodelijke wapen in te zetten. Een aantal antimicrobiële verbindingen maken gebruik van de bekende 'Trojaans paard'-strategie:ze presenteren zichzelf aan een cel als een waardevolle verbinding en, eenmaal binnen, ontketen de 'Acheans' die kunnen, bijvoorbeeld, remmen aminoacyl-tRNA synthetasen, sleutelenzymen die nodig zijn voor de vertaling van genetische informatie in eiwitten.

Skoltech Ph.D. student Dmitrii Travin, Professor Konstantin Severinov en Svetlana Dubiley, hoofd van het Biomedisch Onderwijslaboratorium, onderzocht de drie bekende "stallen" van Trojaanse paardenremmers:albomycine, microcine C-gerelateerde verbindingen, en agrocin 84. Deze drie biologische wapens bootsen een siderofoor na (een ijzerhoudende verbinding), een verscheidenheid aan peptiden, en een opine (een bacteriële energiebron).

Zoals de auteurs opmerken, de enige echte manier waarop bacteriën zichzelf kunnen beschermen tegen deze antimicrobiële stoffen, is door hun transporteurs uit te schakelen die de schijnbaar onschadelijke verbinding in de cel opnemen. Ook al kan dat best vaak gebeuren, het mag het potentieel van Trojaanse paardenremmers om tot medicijnen te worden ontwikkeld niet ondermijnen, omdat verschillende pathogene bacteriën op deze manier "uitgeschakeld" worden, worden ook minder schadelijk gemaakt.

Door een bioinformatica-zoekopdracht uit te voeren, het team was in staat om andere genclusters te vinden die vergelijkbaar waren met de clusters die coderen voor bekende antimicrobiële middelen van Trojaanse paarden. "De resultaten van onze beperkte bioinformatica-analyses laten zien dat de diversiteit van de drie klassen van moleculen die hier worden besproken nog niet volledig is benut. Wanneer experimenteel gevalideerd, deze verbindingen kunnen levensvatbare antibiotica worden, ’ concluderen de auteurs in de krant.