Proteïne N-fosforylering speelt een cruciale rol in het centrale metabolisme en de signalering van twee/multicomponenten van prokaryoten. Verder, het bestaat als tussenproduct van enkele belangrijke enzymen bij zoogdieren.

Echter, de huidige verrijkingsmethoden voor O-fosfopeptiden hebben niet de voorkeur voor N-fosfopeptiden vanwege de intrinsieke labiliteit van de P-N-binding onder zure omstandigheden. Daarom, de effectieve N-fosfoproteoomanalyse blijft een uitdaging.

Onlangs, een onderzoeksgroep onder leiding van prof. Zhang Lihua en Pro. Zhang Yukui van het Dalian Institute of Chemical Physics (DICP) van de Chinese Academy of Sciences (CAS) stelde een snelle en effectieve verrijkingsstrategie voor N-fosfopeptiden voor.

Hun studie werd gepubliceerd in Natuurcommunicatie op 4 december

Geïnspireerd door natuurlijk voorkomende fosfatasen, die specifieke Zn(II)-centrale enzymatische pockets verschaffen om fosfaateenheden van substraten te binden, de onderzoekers ontwierpen bis(zink(II)-dipicolylamine) moleculair (DpaZn) voor herkenning van fosfaatdoelen onder neutrale omstandigheden.

Door het snelle massaoverdrachtsvermogen van sub-2 μm core-shell silicamicrosferen te combineren, DpaZn-gefunctionaliseerde sub-2 μm core-shell silicamicrosferen (SiO ₂ @DpaZn) werden ontworpen voor on-tip N-fosfopeptidenverrijking onder neutrale omstandigheden. In totaal, 3, 384 N-pho-sites, met 611 pH's, 1618 pLys en 1155 pArg, werden geïdentificeerd uit HeLa-cellysaten.

De nieuwe analysemethode voor N-gefosforyleerd proteoom biedt niet alleen basisgegevens voor een diepgaande studie van de biologische functie, maar ook technische ondersteuning voor het bevorderen van de ontwikkeling van precisiegeneeskunde, synthetische biologie en andere gebieden.