Een team van onderzoekers van de Stanford University heeft bewijs gevonden dat glycanen binden aan zoogdier-RNA. De groep heeft een paper geschreven waarin hun bevindingen worden beschreven en deze op de website geplaatst bioRxiv preprint-server.

Glycanen zijn een soort suiker die typisch een rol spelen bij het modificeren van lipiden en eiwitten om moleculaire interacties te vergemakkelijken. In deze nieuwe poging de onderzoekers bestudeerden een proces genaamd glycosylering, een reactie die optreedt wanneer suikermoleculen zich hechten aan eiwitten. Als onderdeel van hun onderzoek hebben een van de teamleden was glycoproteïnen aan het labelen toen hij opmerkte wat leek op een glycaan dat zich aan RNA hecht. Een dergelijke gebeurtenis was nog nooit eerder waargenomen. Bij nadere beschouwing bleek dat het een bepaald type suiker was, een N-gebonden glycaan, en dat het bleef plakken aan Y-RNA - een klein RNA-molecuul waarvan wordt aangenomen dat het een rol speelt bij DNA-replicatie.

RNA wordt meestal gevonden in de kern en het cytosol in cellen. Glycosylering vindt in het algemeen plaats in de Golgi-lichamen en het endoplasmatisch reticulum. Dus, zodat de twee moleculen elkaar ontmoeten, een van hen zou celcompartimenten moeten betreden op manieren die nog niet eerder zijn gezien. Een andere mogelijkheid zou een molecuul zijn dat als tussenpersoon dient.

De onderzoekers waren natuurlijk nogal sceptisch over de vondst, wat leidde tot pogingen om aan te tonen dat het een anomalie was. Als onderdeel van die inspanning, ze probeerden eiwitten te scheiden, maar ontdekten dat het monster dat ze hadden gevonden alleen gevoelig was voor enzymen die de neiging hebben om RNA te knippen. Verdere testen toonden aan dat dergelijke bindingen ook optraden in celkweken van hamsters en muizen. Eindelijk ervan overtuigd dat ze iets nieuws op het spoor waren, de onderzoekers noemden de gebonden moleculen glycolRNA.

Na wat verdere studie van de gebonden moleculen, de onderzoekers melden dat ze niet konden achterhalen hoe de suikers aan het RNA binden - pogingen om ze te scheiden mislukten, behalve wanneer ze enzymen gebruikten om het ene of het andere molecuul te vernietigen. Ze suggereren dat het waarschijnlijk lijkt dat de koppeling niet op eiwitten is gebaseerd en dat het mogelijk lijkt dat dit te wijten is aan covalente binding.

De bevinding van het team moet nog worden geverifieerd door anderen, maar indien bevestigd, het zal waarschijnlijk een hele nieuwe weg openen voor RNA-onderzoek.

© 2019 Wetenschap X Netwerk