Onderzoekers in Japan hebben een database gemaakt met metabolieten van bloedmonsters die zijn verzameld van meer dan 5, 000 Japanse vrijwilligers, het gratis online beschikbaar maken als een waardevolle bron voor onderzoekers over de hele wereld.

Metabolieten en eiwitten regelen veel van de processen in ons lichaam, en informeren ook over de interactie tussen onze cellen en hun omgeving. Inzicht in deze verbindingen en hoe ze zich meer tot elkaar verhouden, zou onderzoekers kunnen helpen om de gezondheidstoestand van mensen te evalueren en nieuwe gepersonaliseerde behandelingen voor verschillende ziekten te ontwikkelen.

De databank, die bioinformaticus Shu Tadaka van Tohoku University en zijn collega's jMorp noemden, bevat informatie over 306 metabolieten en 256 veel voorkomende eiwitten die bij mensen worden aangetroffen. Dit omvat hun frequentie, concentratie, en hoe vaak ze voorkwamen bij mannen of vrouwen en op welke leeftijd. De database is daarin uniek, in plaats van alleen ruwe gegevens weer te geven, het biedt bezoekers een kans om te zien hoe de verschillende metabolieten grafisch met elkaar correleren, de weg vrijmaken voor verdere studies om te identificeren hoe deze metabolieten en eiwitten zich tot elkaar verhouden.

"De informatie in jMorp wordt verkregen uit statistische gegevens die zijn gemaakt door individuele gegevens te aggregeren, ", zegt Tadaka. "Een onafhankelijke commissie heeft alle ethische kwesties zorgvuldig overwogen voordat ze ons toegang tot deze gegevens gaf."

Soortgelijke databases bestrijken andere landen of regio's, zoals het Verenigd Koninkrijk en de Republiek Ierland, maar sommige hebben beperkingen vanwege inconsistente gegevensverzameling of kleine steekproefomvang. Het grote aantal gezonde personen dat monsters heeft bijgedragen aan jMorp maakt het bijzonder nuttig. De onderzoekers verzamelden en analyseerden ook gegevens met dezelfde methode en bij hetzelfde instituut, waardoor meetfouten worden geminimaliseerd. In aanvulling, ze hebben extra maatregelen genomen om monsters van lage kwaliteit uit te sluiten en om de kwaliteitscontrole tijdens het hele proces van verzamelen te waarborgen, opslaan en analyseren van de plasmamonsters. Deze maken jMorp bijzonder betrouwbaar als bron voor wetenschappers, vooral biochemici en medische onderzoekers.

Om het relevant en nuttig te maken voor andere onderzoekers, het Japanse team heeft jMorp opgezet in een gebruiksvriendelijk formaat waarmee bezoekers gemakkelijk bij de gegevens kunnen komen die ze nodig hebben, evenals trek vergelijkingen en relaties tussen verschillende verbindingen visueel weergegeven. Gebruikers kunnen op naam of specificaties zoeken naar het type verbinding waarnaar ze op zoek zijn. De samenvatting van de gegevens kan worden gedownload en correlatiegrafieken kunnen worden opgeslagen als afbeeldingsbestanden.

De database is een voortdurende inspanning en de onderzoekers produceren bijgewerkte jaarlijkse versies terwijl ze meer monsters verzamelen en analyseren. Ze zijn ook van plan om meer inzicht te bieden in de metabolieten en eiwitten die ze documenteren door nieuwe analysemethoden toe te passen.