Geglycosyleerde eiwitten worden vaak tot overexpressie gebracht in tumorcellen en kunnen dus dienen als tumormarkers, vooral die met het interessante molecuul siaalzuur als hun suikergroep. In het journaal Angewandte Chemie , Amerikaanse wetenschappers rapporteren nu over een bioorthogonale labelingstest voor gesialyleerde glycoproteïnen op basis van een glycoproteomics-benadering. Deze test beoordeelt niet alleen het niveau van gesialyleerde glycanen in de tumorcelmembranen, maar identificeert ook opwaartse of neerwaartse gereguleerde eiwitten direct in het prostaatkankerweefsel.

Tumorcellen worden gekenmerkt door een versneld metabolisme waarbij sommige eiwitten opwaarts en sommige neerwaarts worden gereguleerd in vergelijking met cellen in normaal gezond weefsel. Omdat de kwantiteit en kwaliteit van eiwitten in de cellen kan worden beoordeeld met een proteomics-benadering, wetenschappers proberen een proteomics-testsysteem te gebruiken om de eiwitten die typisch zijn voor het metabolisme van kanker te identificeren en te onderzoeken. Carolyn R. Bertozzi en haar onderzoeksteam van Stanford University hebben gekozen voor een bioorthogonale labelingsstrategie om gesialyleerde glycoproteïnen te identificeren, die vooral interessant zijn omdat de siaalzuur-suikergroep cellen helpt om het immuunsysteem te ontwijken. Hun etiketteringsaanpak past verder het kankerweefsel toe, geen celculturen, het biedt dus een directe beoordeling van het tumormetabolisme in zijn natuurlijke omgeving.

Bij bioorthogonale etikettering, een label, meestal een fluorescerend molecuul, is chemisch gebonden aan doelmoleculen, die vervolgens kunnen worden geïdentificeerd door bio-imaging of massaspectrometrie. Een van de belangrijkste aspecten is dat er zo min mogelijk interferentie is met het normale celmetabolisme. "Nauwkeurige modellen van menselijke biologie zijn bijzonder belangrijk voor onderzoek op het snijvlak van glycowetenschap en menselijke gezondheid, " argumenteren de auteurs. Daarom, ze kozen weefselplakculturen als een vorm van levend menselijk tumorweefsel, omdat "kweken van prostaatweefselplakjes ... directe vergelijkingen mogelijk maken van kankerweefsel en normaal weefsel van dezelfde patiëntbron."

In hun aanpak de weefselplakkweken werden behandeld met een azide-gemodificeerd siaalzuur, die gemakkelijk werd geïntegreerd in het tumorcelmetabolisme. Vervolgens, een fluorescerend label werd chemisch aan de azidegroep gehecht. Na de etikettering, de wetenschappers inspecteerden de weefselplakken ofwel direct door beeldvorming of door massaspectrometrie na cellysis. Ze observeerden duidelijke verschillen tussen het kankerweefsel en het gezonde en vonden karakteristieke eiwitten die omhoog of omlaag gereguleerd waren in het kankerweefsel. Het samenvoegen van dit platform met bestaande glycoproteoomanalysetechnieken zijn toekomstige opties, de auteurs stellen voor, de weg vrijmaken voor het beantwoorden van verdere vragen met betrekking tot de rol van siaalzuur, glycoproteïnen, en kanker.