* mitochondria: Deze organellen zijn verantwoordelijk voor cellulaire ademhaling en energieproductie. Ze hebben hun eigen DNA, los van het nucleaire DNA van de cel en ribosomen die lijken op die in bacteriën. Dit suggereert dat mitochondriën ooit vrijlevende bacteriën waren die door een grotere cel werden overspoeld.

* chloroplasten: Deze organellen zijn verantwoordelijk voor fotosynthese in planten en algen. Ze hebben ook hun eigen DNA en ribosomen die vergelijkbaar zijn met die in bacteriën. Dit suggereert dat chloroplasten ooit vrijlevende cyanobacteriën waren die door een grotere cel werden overspoeld.

De endosymbiotische theorie stelt voor dat deze organellen ooit vrijlevende prokaryoten waren die door grotere cellen werden overspoeld en uiteindelijk in de gastheercel werden geïntegreerd. De overeenkomsten tussen deze organellen en bacteriën in termen van DNA, ribosomen en hun eigen membranen ondersteunen deze theorie sterk.