1. Genetische diversiteit: Dit verwijst naar de variatie in genen binnen een soort. Verschillende hondenrassen behoren bijvoorbeeld allemaal tot dezelfde soort (Canis lupus vertrouwdeis), maar ze hebben een breed scala aan genetische variaties die ze verschillende fysieke kenmerken en temperamenten geven.

2. Soortendiversiteit: Dit verwijst naar de verscheidenheid aan verschillende soorten in een bepaald gebied. Een regenwoud heeft bijvoorbeeld een veel hogere soortendiversiteit dan een woestijn.

3. Diversiteit van ecosysteem: Dit verwijst naar de verscheidenheid aan verschillende ecosystemen in een regio. Een regio kan bijvoorbeeld bossen, graslanden, wetlands en woestijnen hebben, elk met een eigen unieke set soorten en habitats.

Het is belangrijk op te merken dat alle drie biodiversiteitsniveaus met elkaar zijn verbonden. Veranderingen in het ene niveau kunnen de andere beïnvloeden. Een verlies van genetische diversiteit binnen een soort kan het bijvoorbeeld kwetsbaarder maken voor ziekte of veranderingen in het milieu, wat vervolgens kan leiden tot een afname van de diversiteit van soorten.