1. Membraangebonden kern: Eukaryotische cellen worden gedefinieerd door de aanwezigheid van een kern, een membraangebonden organel die het genetische materiaal van de cel herbergt (DNA).

2. Membraangebonden organellen: Naast de kern hebben eukaryotische cellen andere membraangebonden organellen, zoals mitochondriën, Golgi-apparaat, endoplasmatisch reticulum, lysosomen, enz. Deze organellen voeren gespecialiseerde functies in de cel uit.

Deze twee kenmerken onderscheiden eukaryoten van prokaryoten, die een kern en andere membraangebonden organellen missen.