* cilia: Dynein is een motorische eiwit dat "loopt" langs microtubuli en de kracht genereert die nodig is voor het slaan van cilia. Deze beweging is essentieel voor veel functies, zoals bewegende vloeistoffen en deeltjes over celoppervlakken.

* blaasjes: Dynein speelt ook een rol bij intracellulair transport, met name bij de beweging van blaasjes langs microtubuli. Deze beweging is cruciaal voor het leveren van lading, zoals eiwitten en lipiden, aan verschillende delen van de cel.

Hoewel zowel cilia- als blaasbewegingen afhankelijk zijn van dyneïne, zijn er kleine verschillen in hun specifieke mechanismen. In Cilia is dyneïne georganiseerd in een complexe structuur die gecoördineerde beweging van meerdere microtubuli mogelijk maakt. In het transport van het blaasje maakt dyneïne vaak deel uit van een groter complex dat andere eiwitten omvat die helpen bij vrachtbinding en regulatie.