1. Linkage -analyse:

* Recombinatiefrequentie: Dit is de hoeksteen van genetische mapping.

* hoe het werkt:

* Tijdens meiose wisselen chromosomen genetisch materiaal uit (kruising) en creëren nieuwe combinaties van allelen.

* Hoe dichter twee genen op een chromosoom zijn, hoe minder waarschijnlijk ze worden gescheiden door over te steken.

* De frequentie van recombinatie (hoe vaak de genen worden gescheiden) is direct gerelateerd aan de afstand daartussen.

* gegevens: U moet nakomelingen van kruisen analyseren om de frequentie van recombinatie tussen paren van genen te bepalen.

2. Fysieke kaarten:

* Fysieke afstanden worden gemeten in basenparen. Deze methode analyseert direct DNA -sequenties.

* Soorten gegevens:

* Beperkingsfragmentlengte polymorfismen (RFLPS): Verschillen in DNA -sequentie die invloed hebben op waar restrictie -enzymen DNA snijden.

* enkele nucleotide polymorfismen (SNP's): Variaties met één basenparen in DNA -sequenties.

* Microsatellieten: Repetitieve DNA -sequenties die in lengte variëren en markers bieden voor fysieke mapping.

* sequentiegegevens: Directe sequencing van DNA om de exacte volgorde van nucleotiden te bepalen.

3. Andere technieken:

* chromosomale banding: Deze methode gebruikt kleurstoffen om bandpatronen op chromosomen te visualiseren. Hoewel niet nauwkeurig, kan het algemene locaties bieden voor genen in chromosoomgebieden.

* Fluorescentie in situ hybridisatie (vis): Fluorescerende sondes richten zich op specifieke DNA -sequenties. Hiermee kunt u visualiseren waar een gen zich op een chromosoom bevindt.

Belangrijkste overwegingen:

* resolutie: Fysieke mapping biedt meer precieze genlocaties dan koppelingsanalyse.

* Aanvullende technieken: Vaak wordt een combinatie van benaderingen gebruikt om een vollediger begrip van genposities te krijgen.

Voorbeeld:

Stel je voor dat je drie genen (A, B en C) op een chromosoom in kaart brengt.

* Linkage -analyse: Je zou kunnen vinden dat gen A en gen B recombineert met een frequentie van 10%, terwijl gen B en gen C recombineert met een frequentie van 2%. Dit suggereert dat A en B verder uit elkaar liggen dan B en C.

* Fysieke kaarten: U kunt vervolgens het DNA -gebied dat deze genen bevat, sequenteren en ontdekken dat A en B worden gescheiden door 100.000 basenparen, terwijl B en C worden gescheiden door 20.000 basenparen. Dit bevestigt de relatieve afstanden die zijn vastgesteld door middel van koppelingsanalyse.

Laat het me weten als je meer gedetailleerd wilt over een van deze methoden of nog vragen hebt!