* Recessieve allelen: Als een persoon twee kopieën van een recessief allel draagt, zullen ze de eigenschap uitdrukken die aan dat allel is gekoppeld. Als ze echter slechts één kopie van het recessieve allel en één kopie van het dominante allel dragen, zullen ze de eigenschap niet uitdrukken. Ze zijn dragers van het recessieve allel, wat betekent dat ze het kunnen doorgeven aan hun nakomelingen.

* Onvolledige dominantie: In sommige gevallen is geen van beide allel volledig dominant ten opzichte van de ander. In plaats daarvan vertoont het heterozygote individu een fenotype dat een mix is van de twee homozygote fenotypes. Dit kan worden waargenomen in Snapdragon -bloemkleur, waarbij een rode bloem kruist met een witte bloem roze nakomelingen produceert.

* Codominance: In codominantie worden beide allelen gelijkelijk uitgedrukt in het heterozygote individu. In bloedtype AB worden bijvoorbeeld zowel de A- als de B -allelen uitgedrukt, wat resulteert in een fenotype dat verschilt van beide homozygote genotype.

* epistasis: Dit gebeurt wanneer de expressie van het ene gen de expressie van een ander gen maskeert. In Labrador -retrievers is het gen voor kleerkleur (zwart of bruin) bijvoorbeeld epistatisch voor het gen voor jaspigment (aanwezigheid of afwezigheid van pigment). Een hond met twee exemplaren van het recessieve "E" -allel op de pigmentlocus zal geel zijn, ongeacht het genotype op de kleuroverplicht.

* stille mutaties: Deze mutaties veranderen de aminozuursequentie van een eiwit niet. Daarom hebben ze geen invloed op het fenotype.

* Niet-coderend DNA: Een aanzienlijk deel van het genoom is niet-coderend DNA. Dit DNA bevat geen instructies voor het bouwen van eiwitten en draagt niet direct bij aan het fenotype.

Het is belangrijk op te merken dat zelfs als een gen niet tot expressie wordt gebracht in een fenotype, het nog steeds aanwezig kan zijn in het genoom van het individu en kan worden doorgegeven aan hun nakomelingen.