Er zijn veel mechanismen die kunnen leiden tot reproductieve isolatie, waaronder:

* Pre-zygotische isolatie: Dit gebeurt vóór de vorming van een zygoot (bevrucht ei). Voorbeelden zijn:

* Habitatisolatie: Soorten leven in verschillende habitats en komen zelden tegen elkaar.

* Tijdelijke isolatie: Soorten broeden op verschillende tijdstippen van de dag of het jaar.

* Gedragsisolatie: Soorten hebben verschillende verkeringsrituelen of paringsgedrag.

* Mechanische isolatie: Soorten hebben onverenigbare reproductieve structuren.

* Gametisch isolatie: Eieren en sperma van verschillende soorten zijn onverenigbaar.

* post-zygotische isolatie: Dit gebeurt na de vorming van een zygote. Voorbeelden zijn:

* Verminderde hybride levensvatbaarheid: Hybride nakomelingen ontwikkelen zich niet.

* Verminderde hybride vruchtbaarheid: Hybride nakomelingen zijn steriel.

* Hybride afbraak: Hybriden van de eerste generatie zijn vruchtbaar, maar de volgende generaties verliezen de vruchtbaarheid.

Deze mechanismen behouden, in combinatie met andere evolutionaire druk, het genetische onderscheidend vermogen van verschillende soorten en voorkomen dat ze in één fuseren.