Dit is waarom:

* Hydrofobiciteit: TRP is een zeer hydrofoob aminozuur, wat betekent dat het water afstoot. Het is waarschijnlijker dat het wordt begraven in de kern van een eiwit, weg van de waterige omgeving.

* polariteit: GLN is polair en kan waterstofbruggen vormen met watermoleculen. Dit maakt het compatibeler met de hydrofiele omgeving van het eiwitoppervlak.

* Grootte: TRP is een groot aminozuur met een omvangrijke zijketen, waardoor het minder geschikt is voor blootstelling aan oppervlakte. GLN daarentegen heeft een kleinere zijketen die gemakkelijker oppervlakte -interacties kan herbergen.

Uitzonderingen:

Hoewel GLN over het algemeen meer aan het oppervlak is blootgesteld dan TRP, zijn er uitzonderingen:

* Specifieke eiwitstructuren: Sommige eiwitten kunnen specifieke structurele vereisten hebben die de aanwezigheid van TRP op het oppervlak vereisen.

* Functionele rollen: TRP-residuen kunnen soms betrokken zijn bij de eiwitfunctie en kunnen daarom op het oppervlak worden gevonden, zoals in eiwit-eiwitinteracties of bindingsplaatsen.

Samenvattend:

De algemene vuistregel is dat TRP eerder in het interieur van een eiwit wordt begraven, terwijl GLN waarschijnlijk op het oppervlak wordt gevonden vanwege zijn hydrofiele aard en kleinere grootte. Er zijn echter uitzonderingen op deze regel, afhankelijk van het specifieke eiwit en de functionele vereisten.