Sommige codons worden echter beschouwd als preferente codons in een bepaald organisme of celtype. Deze voorkeurscodons worden vaker gebruikt in eiwitsynthese en ze kunnen efficiënter zijn in vertaling. Factoren die de voorkeur van codon beïnvloeden, zijn onder meer:

* soorten: Verschillende soorten hebben verschillende voorkeurscodons.

* gen: Binnen een soort kunnen verschillende genen verschillende voorkeurscodons hebben.

* Celtype: Zelfs binnen hetzelfde organisme kunnen verschillende celtypen verschillende preferente codons hebben.

Waarom bestaan ​​er preferente codons?

* TRNA -overvloed: Cellen hebben verschillende hoeveelheden verschillende tRNA -moleculen. Codons die overeenkomen met meer overvloedige TRNA's hebben over het algemeen de voorkeur.

* vertaalefficiëntie: Sommige codons zijn efficiënter in het vertalen dan andere. Dit kan te wijten zijn aan de structuur van het tRNA of de interactie met het ribosoom.

Voorbeelden van voorkeurscodons:

* Bij mensen, aug is het meest voorkomende startcodon en uag , uaa , en uga zijn de meest voorkomende stopcodons.

* Voor de aminozuurleucine, cua is een minder geprefereerde codon in vergelijking met uua of CUG .

Conclusie:

Hoewel alle 64 codons geldig zijn, hebben sommige de voorkeur boven andere, afhankelijk van factoren zoals soorten, gen en celtype. Deze voorkeurscodons worden efficiënter vertaald en dragen bij aan de algehele efficiëntie van eiwitsynthese.