Cilia en flagella zijn haarachtige structuren die uit het celoppervlak steken. Ze zijn samengesteld uit microtubuli, dit zijn lange, dunne eiwitfilamenten. Cilia en flagella zijn betrokken bij verschillende cellulaire functies, waaronder:

- Beweging: Cilia en flagella kunnen worden gebruikt om cellen door hun omgeving te verplaatsen. De trilharen op het oppervlak van epitheelcellen van de luchtwegen helpen bijvoorbeeld om slijm en opgesloten deeltjes naar boven en uit de longen te verplaatsen. De flagellen op het oppervlak van de zaadcellen helpen hen tijdens de bevruchting naar de eicel te zwemmen.

- Waarnemen: Cilia en flagella kunnen ook worden gebruikt om de omgeving waar te nemen. De cilia op het oppervlak van sensorische neuronen kunnen bijvoorbeeld veranderingen in temperatuur, druk en chemische samenstelling detecteren. De flagellen op het oppervlak van bacteriën kunnen hen helpen voedsel te vinden en schadelijke stoffen te vermijden.

- Celsignalering: Cilia en flagella kunnen ook worden gebruikt om met andere cellen te communiceren. De cilia op het oppervlak van immuuncellen kunnen hen bijvoorbeeld helpen vreemde indringers te herkennen en eraan te binden. De flagellen op het oppervlak van bacteriën kunnen hen helpen met elkaar te communiceren en hun activiteiten te coördineren.

Cilia en flagella zijn essentieel voor de functie van veel verschillende soorten cellen. Ze spelen een rol bij beweging, detectie, celsignalering en andere belangrijke cellulaire processen.