Science >> Wetenschap >  >> Biologie

Het transcriptoom van een schadelijk onkruid samenstellen:nieuwe bronnen om te bestuderen hoe planten binnendringen

Titel: Het transcriptoom van een schadelijk onkruid samenstellen:nieuwe bronnen om te bestuderen hoe planten binnendringen

Samenvatting:

*Invasieve planten* zijn niet-inheemse soorten die zich snel verspreiden en een negatieve impact hebben op ecosystemen, de landbouw en de menselijke gezondheid. Het begrijpen van de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan hun succes is cruciaal voor het ontwikkelen van effectieve managementstrategieën. *Ambrosia artemisiifolia* (gewone ambrosia) is een schadelijk onkruid afkomstig uit Noord-Amerika dat vele delen van de wereld is binnengedrongen en aanzienlijke economische en gezondheidsproblemen veroorzaakt. Hier doen we verslag van de *de novo* montage van de *A. artemisiifolia* transcriptoom met behulp van Illumina short-read sequencing. Onze assemblage leverde een transcriptoom van hoge kwaliteit op met meer dan 100.000 transcripties en een BUSCO-volledigheidsscore van 97,1%. We hebben het transcriptoom geannoteerd met behulp van verschillende databases en vermoedelijke orthologen geïdentificeerd voor genen die betrokken zijn bij belangrijke biologische processen, waaronder fotosynthese, stressreactie en reproductie. Onze transcriptoomgegevens vormen een waardevolle bron voor verder onderzoek naar de moleculaire ecologie, evolutie en beheer van *A. artemisiifolia* en andere invasieve planten.

Zoekwoorden: *Ambrosia artemisiifolia*, transcriptoomassemblage, genexpressie, invasieve planten, moleculaire ecologie