Science >> Wetenschap >  >> Biologie

Elektrische velden in kaart brengen om te helpen ontrafelen hoe enzymen werken

Het in kaart brengen van elektrische velden is een krachtig hulpmiddel dat kan helpen ontrafelen hoe enzymen werken. Door het elektrische veld rond een enzym te visualiseren, kunnen onderzoekers inzicht krijgen in de actieve plaats van het enzym en de interacties die plaatsvinden tussen het enzym en zijn substraat. Deze informatie kan worden gebruikt om nieuwe medicijnen en remmers te ontwerpen die zich op specifieke enzymen richten.

Elektrische velden ontstaan ​​door de beweging van geladen deeltjes. In een enzym wordt het elektrische veld gegenereerd door de beweging van elektronen tussen de actieve plaats van het enzym en het substraat. Deze beweging van elektronen creëert een positieve lading op de actieve plaats, die het negatief geladen substraat aantrekt. Het elektrische veld helpt ook om het substraat in de juiste positie voor katalyse te oriënteren.

Het in kaart brengen van elektrische velden kan met behulp van verschillende technieken, waaronder:

* Elektrostatische potentiaaltoewijzing: Deze techniek maakt gebruik van computationele methoden om het elektrische potentieel rond een enzym te berekenen. Het elektrische potentieel is een maat voor de hoeveelheid elektrische energie op een bepaald punt in de ruimte.

* Diëlektrische constante mapping: Deze techniek maakt gebruik van een sondemolecuul om de diëlektrische constante van de omgeving rond een enzym te meten. De diëlektrische constante is een maatstaf voor hoe goed een materiaal elektrische energie kan opslaan.

* Fluorescentie-resonantie-energieoverdracht (FRET): Deze techniek maakt gebruik van twee fluorescerende kleurstoffen om de afstand tussen twee punten op een enzym te meten. FRET kan worden gebruikt om het elektrische veld rond een enzym in kaart te brengen door de veranderingen in de afstand tussen de twee kleurstoffen te meten.

Het in kaart brengen van elektrische velden is gebruikt om een ​​verscheidenheid aan enzymen te bestuderen, waaronder:

* Proteasen: Proteasen zijn enzymen die eiwitten afbreken. Het in kaart brengen van elektrische velden is gebruikt om de actieve plaats van proteasen en de interacties tussen proteasen en hun substraten te bestuderen.

* Kinasen: Kinasen zijn enzymen die een fosfaatgroep aan eiwitten toevoegen. Het in kaart brengen van elektrische velden is gebruikt om de actieve plaats van kinasen en de interacties tussen kinasen en hun substraten te bestuderen.

* Fosfatasen: Fosfatasen zijn enzymen die een fosfaatgroep uit eiwitten verwijderen. Er is gebruik gemaakt van het in kaart brengen van elektrische velden om de actieve plaats van fosfatasen en de interacties tussen fosfatasen en hun substraten te bestuderen.

Het in kaart brengen van elektrische velden is een krachtig hulpmiddel dat kan helpen ontrafelen hoe enzymen werken. Deze informatie kan worden gebruikt om nieuwe medicijnen en remmers te ontwerpen die zich op specifieke enzymen richten.